Первое документальное упоминание о деревянной церкви во имя пророка Илии в селе Подгоры относится к первой половине XVII века в 1640 году. В 1860 году было начато возведение кирпичного здания взамен деревянного. В 1890 году строительство кирпичного здания церкви было завершено. В начале 1930-х годов церковь была закрыта, здание частично разрушено; сохранившаяся часть использовалась не по назначению.
С 1993 года в селе был зарегистрирован — и с тех пор действует — православный приход церкви во имя пророка Илии. В октябре 1993 года глава администрации Волжского района Василий Явон подписал Постановление, согласно которому Самарской епархии был выдан Государственный акт на право собственности 0,49 гектарами земли в селе Подгоры.
Восстановительные работы в полуразрушенном храме начались в 1998 году. К маю 2003 года храм был поднят из руин, украшен красными куполами в цвет огненной колесницы пророка Илии. На купола водружены золотые кресты. 10 июня 2003 года в храме была отслужена первая за последние восемьдесят лет Божественная литургия. С этого времени богослужения проводились уже регулярно.
Осенью 2004 года в монастыре было начато строительство деревянного храма во имя самарского святого – священномученика Константина Сухова. 22 октября 2007 года великое освящение храма и первую Божественную литургию архиерейским служением провел архиепископ Сергий.
С 2005 года в Ильинском храме начались ежедневные службы по полному уставному чину. Здесь круглосуточно читается Неусыпаемая псалтырь. Позднее скит был преобразован в Заволжский Свято-Ильинский женский монастырь. На сегодняшний день в обители возведены небольшие келейные корпуса, игуменский дом, дом для священнослужителей. Завершено строительство домового храма во имя великомученицы Анастасии Узорешительницы в игуменском доме.
