Первоначально домовая Толгская церковь была устроена в 1799 г. помещиком А.И. Майковым при своем доме в с. Анисове Романово-Борисоглебского уезда. В течение века церковь переходила от одного владельца к другому; последний владелец — генерал-майор Н.П. Павлов — в 1902 г. решил подарить церковь мужской гимназии. С разрешения епархиального начальства, подтвержденного Св.Синодом, и с согласия Попечителя Московского учебного округа дар был принят 14 ноября 1902 г. В начале 1903 г. приступили к устройству храма, пожертвованные вещи (среди них – иконостас) ремонтировали на средства училища и жертвователей. Освящение Толгской церкви состоялось 9 ноября 1903 г. епископом Угличским, викарием Ярославским Сергием.
Однопрестольная церковь помещалась в здании мужской гимназии на третьем этаже, в угловой зале на юго-восток. Пол комнаты был «выложен дубовым паркетом, стены окрашены светло-голубой краской, церковь освещалась тремя окнами». Причт состоял из одного священника, который получал жалованье по должности законоучителя. Все церковные расходы находились в ведении хозяйственного правления гимназии.
В ноябре 1918 г. церковное имущество домовой церкви при Ярославской мужской гимназии было принято на хранение в ярославскую городскую Крестовоздвиженскую церковь.
ГАЯО. Ф.230. Оп.2. Д.5055. Л. 77-82, Д.5135. Л.81-86, Р-773. Оп.4 Д99 Л. 278-279. http://sazonow.ru/khramy-i-monastyri/121-dokumenty-gosudarstvennogo-arkhiva-yaroslavskoj-oblasti-po-istorii-domovykh-tserkvej-yaroslavskoj-eparkhii-xix-nach-khkh-vv