Церковь названа Спасской по своему главному престолу – Спаса Преображения. Вторая часть топонима – «на Болоте» – указывает на наличие в этом месте в древности низины, болотца. В старину приставка «на Болоте» одно время была и у других вологодских храмов, расположенных в двух-трех кварталах от Спасо-Болотской церкви – Параскевы Пятницы и во имя Казанской иконы Божией Матери (территория нынешнего Старого базара).
Церковь Спаса Преображения на Болоте после утверждения Екатериной II Генерального плана застройки Вологды оказалась на пересечении Богословской (ныне ул. Воровского) и Громовской улиц (часть современного проспекта Победы).
Каменная одноэтажная трехпрестольная церковь Спаса Преображения на Болоте чрезвычайно похожа по своим архитектурным формам на церковь Воскресения на Ленивой площадке, и хотя она была возведена на шесть лет позднее последней – в 1768 году, – ряд исследователей считают, что оба храма построены одним мастером.
Спасо-Преображенский храм венчает такое же пятиглавие, как и у Воскресенской церкви. Главки также двухъярусные, но более вытянутые. Богаче карниз, венчающий четверик и двухъярусные главки трапезной над приделами Входоиерусалимским и Тихона Амафунтского. Много общего и в архитектурном исполнении колокольни. Заметна разница в архитектуре крылечка: у Спасской церкви оно тоже состоит из колонок, но последние покрыты фронтонами, в которых вырезаны полукружия, отсутствует купольное завершение.
Стены храма были покрашены в голубые и белые тона, ярко синие купола виднелись далеко в округе, наличники окон подобны наличникам Cpетенской церкви, что на Набережной VI Армии. Фронтоны их состоят из причудливых срезанных округленных кусочков карниза, насаженных на части разорванного фронтона. В виде образцов для деталей такого барокко, очевидно, послужили лучшие подмосковные церкви конца XVII века.
В целом, архитектура храма типична для конца XVIII века. В это время в Вологде стиль барокко постепенно терял свою популярность, и провинциальные зодчие разрабатывают свои архитектурные формы, соединяющие в себе детали различных направлений. Так, архитектура церкви Спаса на Болоте объединяла в себе русскую традицию с итальянской, однако следование национальным формам здесь очень сильно. В интерьере храма Спаса на Болоте известный исследователь Вологды Г.К. Лукомский выделял, как представляющие наибольший интерес, две печи с зелено-желто-белыми изразцами, иконостас «спокойных форм» и несколько древних икон – преподобного Тихона, Преображения Господня в богатом окладе конца XVII века, Николая Чудотворца. Внутри храм имел старинную живопись, слегка подновленную в XIX веке. На начало 1930 года на колокольне Спасо-Преображенской церкви имелось 13 колоколов общим весом 218 пудов.
Спасо-Преображенская Болотная церковь была закрыта для богослужений 6 марта 1930 года вместе с такими вологодскими церквями, как Благовещенская, Богородская Нижнедольская, Дмитриевская (оба храма), Никольская Владыченская, Пятницкая. В мае-июле 1930 года уполномоченные религиозных общин обращались в губернский и окружной административные отделы с просьбой вернуть приходские храмы, мотивируя это тем, что изначально закрытие молитвенных зданий носило временный характер. Однако их просьба не была удовлетворена.
Семь лет закрытый храм стоял пустым: городские власти, несмотря на нехватку помещений, так и не решились «поселить» здесь какие-либо советские учреждения. Причиной этому послужило неудобное месторасположение бывшего культового здания посередине проезжей части. В начале 1930-х годов храм лишился куполов с крестами, а затем и завершения колокольни. В 1937 году он был окончательно разобран.
http://cultinfo.ru/infoproject/temples/index.php?id=57