История Успенской обители в 1552 году начинается с возведения «во един день» деревянной Успенской церкви, по царскому указу и на месте царской ставки. Разлив Казанки в 1559 году или 1560 году размыл и разрушил эту церковь, как и все первоначальное место монастыря. Но и после перенесения обители на саму Зилантову гору новый деревянный храм был посвящён Успению Пресвятой Богородицы. История каменного Зилантова монастыря открывается строительством каменного Успенского собора. Бытует предание о том, как Иоанн Грозный лично распорядился «снять меру» с Троицкого собора Свято–Троицкой Сергиевой Лавры и построить на Зилантовой горе его точный образец, дабы и в духовном плане монахи во всем подражали житию братии святой Лавры». Это было выполнено, но только при первом из Романовых Михаиле Федоровиче и 15 августа 1625 года новый каменный храм был торжественно освящен митрополитом Казанским Матфеем. Богомольный и очень богобоязненный царь Михаил стал не меньшим благодетелем для Зилантовой обители, чем Иоанн Грозный. Все иконы и всё убранство были лично пожертвованы государем в Успенский собор в том же 1625 году. С тех пор многие из них сохранялись до самой революции. Иконостас собора напоминал лаврский. Как рассказывается в описи 1813 года, он весь «старинной столярной работы, выкрашенный разными красками, местами позолотою». Первый раз храм обновлялся в 1729 году. Вероятно, в это время появляется и галерея, соединившая собор с Всехсвятской церковью. Почти ровно век спустя, в 1835 году, храм еще раз «обновили», и 15 августа собор вновь был освящен архиепископом Казанским Филаретом. Его облик, в отличие от сильно перестроенной тогда Всехсвятской церкви, почти не изменился. В 1895 году в подвальном этаже храма обустроен склеп-усыпальница во имя Святой Равноапостольной Ольги. Склеп сооружен на средства Ольги Сергеевны Гейнс, вдовы погребенного там ее мужа военного инженера генерал-губернатора Казани А. К. Гейнса. Захоронения же под собором были и раньше, просто в 1895 году там поставили подземный св. престол для совершения заупокойных литургий. Главная святыня храма и всего монастыря, икона Смоленский Божией Матери. В народе её почитали чудотворной. Это была одна из двух особо почитаемых Смоленских Богородицких икон нашего края, вторая всем известна как Седмиозерная. В «Справочной книге Казанской епархии» 1909 года среди реликвий монастыря названа еще икона Господа Саваофа «также весьма древнего письма». К святыням древнего храма необходимо отнести и гробницу архиепископа Иосифа Суздальского. Вот, что записано о нем в древних монастырских Сунодиках, «оставив стадо волею, и придя 1640 года в обитель на подвиг покаяния, и прибывая в молитве, пении, самоумерщвлении, кротости, вольной нищеты, учительств и милостыне к меньшим, предвидя кончину и 15 июня 1642 года к Богу отойдя». Гробница находилась при входе в собор с левой стороны и над ней постоянно теплилась неугасимая лампада в память святителя.
Когда в советское время собор был до основания снесен, оказались утраченными почти все его святыни и утерянными места захоронений и святителя Иосифа, и всех, кто был погребен в подземном приделе Святой Ольги.
Сегодня в продолжение славных традиций обители, на месте Успенского собора стоит новый Троицкий храм построенный по проекту, что и Троицкий собор в Троице-Сергтевой лавре, а Всехсвятская церковь после реставрации в 2000 году освящена в честь Успения Пресвятой Богородицы
