Во второй половине XVIII века село Никольское Боровского уезда (вместе с деревнями Папино и Чубарово) принадлежало Александру Петровичу Глебову, при котором возвели большой каменный главный дом усадьбы, со сводчатым нижним этажом. За домом находился прямоугольный регулярный сад, вытянутый с севера на юг. Церковь стояла к югу от дома.
Такая планировка сохранялась вплоть до середины XIX века. Во второй половине XIX века регулярный парк развили в западном направлении. В 1878 году при церкви заново возвели колокольню и трапезную.
В первой половине – середины XIX века усадьбой владели князья Урусовы, после них – помещик Жуков, далее – Ф.Е.Струве, хозяин Коломенского паровозостроительного завода, в начале XX века и до 1917 года – А.А. и Е.А.Холецкие.
В советский период церковь закрыли и частично разрушили, остальные части усадьбы постепенно деградировали, парк сильно зарос. В здании храма размещалась столовая детского туберкулезного санатория.
К 2000-ым годам хозяйственные постройки были утрачены, главный дом находился в руинированном состоянии: почти полностью были утрачены перекрытия, части внутренних стен.
В результате проведенных в конце 2000-х – начала 2010-х гг. реставрационных и восстановительных работ дом воссоздан с сохранением фрагментов подлинной кладки стен и основы внутренней планировки. Частично сохранились своды первого этажа. В конце 2014 года на сайте Российского аукционного дома появилось сообщение о выставлении усадьбы Никольское на торги. Заявленная начальная цена лота 821 миллион рублей.