Музей создавался на общественных началах в 60-е годы XX века. У истоков его создания были учителя Тюменцевской средней школы — Кочергова Агния Деомидовна, краевед Юрий Сергеевич Орлов. Орлов Ю. С. занимался раскопками курганов с учениками. Именно эти находки легли в основу музея. В 1967 году учениками и учителями Тюменцевской средней школы специально для музея было построено одноэтажное кирпичное здание. 6 ноября 1967 года — дата открытия Ленинского школьного музея.
С 2003 года музей стал муниципальным учреждением «Тюменцевский районный историко-краеведческий музей». Фонды музея насчитывали не более 500 предметов. Сейчас основной фонд насчитывает 5 078 предметов. Это коллекции этнографии, декоративно-прикладного искусства, нумизматики и др. С 2011 года музей регулярно принимает участие в краевой грантовой политике.
В 2017 году произошла реорганизация, музей стал сектором «Тюменцевский районный историко-краеведческий музей» МБУК «Многофункциональный культурный центр» Тюменцевского района Алтайского края. В этом же году музей переехал в новое помещение. Увеличилась площадь музея, улучшились условия хранения, обновлено оборудование. Появился выставочный зал. Музей стал более современным. Экспозиция выстраивалась как цепь сменяющих друг друга культурно-исторических ситуаций-моделей: от архаической до новейшего времени. Экспозиция стала более познавательной и увлекательной за счет разных типов подлинных экспонатов, макетов, интерьеров, музейных инсталляций.
