Согласно византийским источникам, существование монастыря прослеживается с VIII в. Встречается (в житии одного из его игуменов) дата 709 г. Во время гонений императора Константина Копронима на иконопочитателей в середине VIII в. монастырь, к тому моменту уже довольно крупный (братия достигала нескольких десятков человек) был разорен отрядом под началом Михаила Лаханодракона. Часть монахов погибла при набеге, часть была отвезена в Эфес и там предана смерти или пыткам.
Возможно, монастырь разорялся во время иконоборчества не единожды, так как среди пострадавших за иконопочитание называют нескольких его настоятелей: священномученик Иларион Новый (Пеликитский) — согласно житию, прославился многочисленными чудесами и погиб во время разорения монастыря иконоборцами в 754 г. (согласно житию, святой Иларион принял мученическую смерть в Великий четверг, хотя в тот момент иконоборческий собор еще не завершился); священномученик Феостирикт Пеликитский — считается (из жития священномученика Стефана Нового), что погиб в 763/764 г., во время нападения на монастырь Михаила Лаханодракона; святой преподобный Макарий Пеликитский — был настоятелем в начале IX в. и пострадал во время гонений императора Льва V Исавра (но не погиб, а был арестован и позже сослан на остров Афусию; игуменом вместо него был избран инок Сергий).
От монастыря сохранились руины собора и хозяйственных построек вокруг. Здание собора неоднократно перестраивалось. Наиболее старую, восточную часть датируют Х в.
В 1855 г. собор сильно пострадал от землетрясения и был восстановлен в 1856 г. Тогда же была пристроена западная часть (ранее над входом имелась каменная табличка с этой датой).
В 1880 г. монастырь сильно пострадал от пожара и после восстановления перешел под управление семинарии на о. Хейбелиада.
После депортации греческого населения монастырь был заброшен, на его руинах устроена ферма.
