Расположена на территории Богородице-Алексиевского мужского монастыря к северо-западу от храма Казанской Божией Матери. Феодор Кузьмич умер в домике-келье во дворе усадьбы С.Ф. Хромова на углу улиц Монастырская и Нечаевская (теперь улицы Крылова и Фрунзе). Келья сразу стала городской достопримечательностью. Посещали ее многие гости Томска, в том числе наследник престола Российского, будущий царь Николай II в сопровождении князей Кочубея и Ухтомского. Дом Хромова хоть и в измененном виде, но сохранился, а келья снесена в советское время. Сейчас на этом месте растут четыре липы и две ели. 23 января 1864 г. в храме состоялось отпевание старца Феодора Кузьмича, погребенного к северо-востоку от алтарей храма. Могила старца сразу стала местом настоящего паломничества. В 1904 г. на средства его почитателей над могилой была построена часовня по проекту архитектора В.Ф. Оржешко. Часовня была разобрана в 1936 г., после закрытия монастыря (1923 г.) и приходской общины (1929 г.). Под слоем обломков и земли было скрыто и само ее местоположение. К 1959 году все, что было связано с именем Федора Кузьмича, было предано забвению.
В 1984 г. состоялась канонизация старца в составе «Собора Сибирских Святых и подвижников благочестия, в земле Сибирской просиявших». В 1991 году во время «Томского хода», организации и частные лица собрали достаточно приличные деньги, на которые был заказан проект восстановления часовни. В 1995 г. по благословению владыки Тихона, епископа Новосибирского (в то время Томск не имел своего епископа) силами Томской Духовной семинарии были произведены раскопки по поиску захоронений Федора Кузьмича. 6 июля 1995 года торжественным молебном мощи были обретены. Они помещены в специальную раку и залиты восковой мастикой с елеем, привезенным из Иерусалима, которые находятся сейчас в Казанском храме. В 1997-1998 гг. часовня-памятник святого Феодора была восстановлена по первоначальному проекту на прежних фундаментах. Согласно легенде, старец Федор Кузьмич — не кто иной, как император Александр I, отрекшийся от престола и ушедший в Сибирь отмаливать грех отцеубийства. В пользу этого говорят как во многом загадочные обстоятельства смерти самого Александра, так и неоднократные «опознания» старца современниками. Зафиксирован факт долгой беседы с Федором Кузьмичем цесаревича Александра Николаевича во время его путешествия в Сибирь.
Использованы материалы сайта tomsk.gov.ru и путеводителя «Сибирь» изд. «Вокруг Света»
Произошло это за месяц до обретения мощей Св. Праведного Феодора Томского. В то время (в июле месяца 1995 г.) ходили по г.Томску книги, в киосках, В.В. Барятинского: » Царственный мистик (Император — Феодор Кузьмич). Мне тогда посчастливилось удачно окончить иконописные курсы при Петропавловском соборе при благочинном О. Леониде (у преподавателя Емановой Людмиле Николаевной). Прочитав книгу о Феодоре Кузьмиче, вдруг охватило желание написать его икону. Как потом оказалось, что икона была закончена за две недели до обретения мощей. Тогда, в 1995 г., настоятелем Казанской церкви при только восстанавливающимся монастыре, был иеромонах Сергий. Когда произошло обретение мощей св. старца Феодора, икона была передана отцу Сергию и получилось так, что день обретения мощей совпал с днем написания и передачи иконы (образа св. прав. Феодора). Что подтолкнуло отдать икону? Подтолкнуло отдать икону, наверное, уже тогда его почитание и сон. Дело в том, что в ночь с 4 на 5 июля, когда семинаристы откапывали склеп Феодора Кузьмича, мне приснился сон, как будто из склепа отодвигают плиту и все находящиеся вдруг произнесли: «Александр-I!» Рассказав тогда о сне Отцу Сергию, на что он ответил: «Это от Бога».
Из воспоминаний иконописца Юрия Николаевича Водзинского