Русская церковь в Южном Тироле возникла в конце XIX века, когда эти земли еще входили в пределы Австро-Венгерской империи. С середины XIX века небольшой городок становится популярным курортом, в том числе и среди русских, которые все чаще приезжали сюда, чтобы поправить свое здоровье. Мерано привлекал не только мягким климатом, но и красотой окружающего пейзажа, величием Альп.
В 1870-х годах в Мерано существовала уже хорошо сложившаяся местная русская колония. А для поддержки русских курортников и оказания им не только медицинской помощи, но и всевозможной иной (в том числе и снять недорогое жилье в пансионах) в 1875 году было учреждено частное благотворительное общество русских жителей Мерано (Русский комитет), которое существовало на пожертвования его членов, преимущественно врачей, тут практиковавших.
Русские люди, приезжавшие лечиться в Мерано, испытывали нужду не только в дешевом пансионате, но и в православных богослужениях. Можно предположить, что у многих туберкулезных больных религиозное чувство было обострено сознанием хрупкости их земного существования. К обостренному религиозному чувству здесь, за границей, в чужом по культуре и вере окружении, возможно, примешивалась и ностальгия по родине, по «святой Руси». Все это побудило комитет начать хлопоты по устройству церкви. В 1884 году Русский комитет, с русским врачом Михаилом фон Мессингом во главе, обратился к петербургскому митрополиту Исидору (Никольскому) с просьбой благословить образование православного прихода в Мерано во имя святителя Николая.
Посвящение нового русского храма святому Николаю, несомненно, было символическим актом: святитель Николай – самый чтимый на Руси святой. Устройству церкви помог – по крайней мере, своим авторитетом – протоиерей Иоанн Кронштадтский: знаменитый «батюшка всея Руси» входил в состав комитета благотворительного общества. Правда, каких-либо конкретных документов, касающихся участия отца Иоанна Кронштадтского в меранском проекте, обнаружить не удалось. Но сегодняшние прихожане храма считают своим небесным покровителем, наряду со святителем Николаем, которому посвящен храм, и праведного Иоанна Кронштадского.
Первоначально церковь разместилась в наемном помещении на вилле Стефани. Но небольшая комната не вмещала всех прихожан, и потому приход стал хлопотать об устройстве «настоящего храма». Этому много способствовало то обстоятельство, что одна из больных, дочь надворного советника Надежда Бородина, так, увы, и не сумевшая справиться со своим недугом, завещала Русскому комитету значительную сумму денег на завершение строительства пансионата для больных из России. Строительство Русского дома имени Бородиной закончилось в 1897 году. Никольскую церковь разместили в верхнем этаже двухэтажного флигеля, увенчав ее куполом русской формы и «русским» крестом.
Торжественное освящение нового храма состоялось 3/15 декабря, перед престольным праздником – днем памяти святителя Николая. Ко дню освящения в Мерано съехались русские со всех соседних курортов Тироля. Уже с утра новый храм был переполнен посетителями. Кроме православных, было немало иноверцев, в том числе и представителей местных властей – начальника округа, управителя курорта, бургомистра, командующего местным гарнизоном и других.
Русский дом имени Бородиной, в который принимались «русские подданные обоего пола христианского вероисповедания, страдающие грудными болезнями, без различия чина и звания» был как бы кусочком России: здесь получали русские газеты и журналы, готовили русскую пищу, после обедни в общей столовой подавалли самовар, чтобы «выпить чаю по русскому обычаю».
Размеренную и спокойную жизнь русского прихода в Мерано оборвала Первая мировая война: осенью 1914 года Мерано для России уже был закрыт.
Приход церкви в Мерано в ХХ столетии пережил последствия всех тех нестроений и перипетий, которые выпали на долю нашего многострадального Отечества. В середине прошлого века Никольский храм чуть не был разрушен. Но, по милости Божией, пришло иное время, – время, когда появилась не только необходимость, но и возможность «собирать камни» и восстанавливать нормальную церковную жизнь.
С начала 1990-х годов православная религиозная жизнь в Мерано постепенно стала возрождаться. 9 июня 1991 года, после долгого перерыва, в Никольском храме стали совершаться поначалу редкие (один-два раза в год) православные богослужения. А в 2002 году здесь была зарегистрирована православная община Московского Патриархата. Первое богослужение в день Пасхи совершил иеромонах Арсений (Соколов).
23 мая 2006 года по благословению митрополита Смоленского и Калининградского Кирилла духовно окормлять меранскую общину был назначен иеромонах Алексий (Никоноров). С того времени богослужения в приходе стали совершаться регулярно, в каждые первый и третий воскресный день месяца.