Часовня Филиппа Митрополита находится к северу от монастыря в начале дороги, ведущей на Секирную гору. Она стоит на берегу сильно обмелевшей заводи. Самое раннее описание часовни (тогда ещё деревянной) встречаем в монастырской описи 1705 года: от «плотничной службы разстоянием 350 сажен на край самый морской губы кладезь, а в нем вода свежая изрядная, тот кладезь построил преосвященный Филипп… И над тем кладезем часовня деревянная четвероугольная рублена, покрыта тесом на два ската з зубцами… Да подле тот кладезь другая часовня деревянная забрана тесом с открывшею, а шия и глава обиты чешуею деревянною. На главе крест осьмиконечный деревянной большой, на нем распятие господне резное писано краски».
Возведение второй деревянной часовни было, видимо, связано с памятью о торжественном перенесении мощей святителя Филиппа из монастыря в Москву в 1652 г. Древние часовни не сохранились. Существующая каменная часовня построена в 1846-1852 г.г. и по своим формам напоминает Петровскую, хотя по размерам несколько больше неё.
С Филипповской часовней связано начало возрождения монастыря в 1989 г. В этом году часовня была передана музеем только что организованной общине во имя святителя Филиппа во временное пользование. В том же году Филипповскую часовню освятил монах Герман (Чеботарь). До 1990 г. прихожане в часовне вычитывали часы и служили акафисты. В 2004 г. часовня была отреставрирована силами монастыря. С сайта solovki.info/?action=pv&id=71
