После закрытия Успенского и Князь-Владимирского соборов роль кафедрального храма Астрахани исполнял Покровский собор, расположенный в северной части города, за рекой Кутум. В ХIХ веке это была глубокая окраина, здесь селились казённые крестьяне, вынужденные обустраивать свои хозяйства на солончаках Болдинской степи. Полноценное освоение и застройка района начались лишь после сильного пожара 1858 года, когда Закутумную часть города отстраивали фактически заново. Сюда переселили большое количество бондарей, колесников и кузнецов. Старые храмы стали тесны для разросшегося местного населения. Стало очевидным, что в центре Селения, как тогда назывался этот район, нужен новый большой храм. Инициатором постройки собора выступил известный астраханский купец Иван Иванович Губин. Он взял на себя большую часть расходов по строительству, а это без малого, 95 тыс. рублей. В благодарность за финансирование и дальнейшую помощь по благоустроению храма Губина избрали пожизненно церковным старостой.
Храм из красного кирпича в стиле эклектики, достаточно оригинальной, если не сказать смелой архитектуры, с неуловимыми восточными мотивами — местный штрих. Большой фигурный купол светового барабана ныне вызолочен, дань современным вкусам, а прежде был серым и гармонично сочетался с красным кирпичом сооружения. Серым же был гранёный шатёр колокольни, который после очередной реставрации оказался почему-то синего цвета, звучащего диссонансом и не гармонирующего с золочёным верхом собора. Право же, играть цветами следовало бы осторожней. Эти обновления внешнего вида были произведены в Покровском кафедральном соборе, приуроченные к 450-летию города. Реконструкция получилась скорее косметической.
Покровскому собору повезло более многих других астраханских храмов. Его не захватили обновленцы, здесь служил и был погребён архиепископ Филипп Ставицкий, известный борец с обновленчеством, не избегший в советское время тюрем и ссылок. Храм закрывался всего на 9 месяцев в 1941 году, при этом его внутреннее убранство не тронули, сохранились росписи, иконостас, святыни, древняя икона Покрова Пресвятой Богородицы и мощевик с частицей Честного Древа Креста Господня. В это время церковное здание использовалось под склад сахара. В 1942 году в храме вновь зазвучали молитвы.
