В 1963 г. в Скопье произошло сильное землетрясение, уничтожившее большую часть исторических построек. В 2010 г. премьер-министр Македонии Никола Груевский решил повысить туристическую привлекательность города и представил проект «Скопье-2014», подразумевавший возведение многочисленных памятников, фонтанов, музеев и административных зданий. Церковь святых Константина и Елены является новоделом, хотя храм здесь построили ещё в начале XX в. В результате землетрясения 1963 г. он получил серьёзные повреждения, а позже был снесён. В 2012 г. на этом месте заложили новую церковь. Храм привлекает внимание высокой колокольней, выстроенной в необычном стиле.


