Деревянная церковь с шатровым куполом и шатровой колокольней была сооружена жителями села Шипуновского в 1899 г., первое богослужение в новопостроенном храме состоялось на престольный праздник — Вознесение Господне. Была приписана к Вознесенской церкви с. Болтово. Приход Вознесенской церкви состоял из с. Шипуновского Барнаульского уезда. В 1914 г. к храму были приписаны деревни Холодная и Фёдоровка, что отразилось на количестве прихожан. В 1911 г. храм посещали 2120 человек, к 1914 г. их число увеличивается до 3270 человек, а в 1920-е г.г. возросло до 3764 человек.
В 1904 г. в селе Шипуновском была открыта церковно-приходская школа. Известно, что в 1911 г. в школе обучались 73 человека. Учителем же была Мария Ивановна Мещерякова. В последние годы жизни она работала сторожем в колхозной конторе. Умерла в 1942 г.
В 1936 г. церковь закрыли и превратили в зерносклад. Но в 1945 г. храм был вновь открыт.
По воспоминаниям старожила села, Ивана Евдокимовича Казака, храм был самым красивым на территории нынешнего Сузунского района. В церковной ограде был разбит небольшой сад. 9 февраля 1964 г. церковь сгорела, но утварь и иконы удалось спасти. Известно, что иконы Спасителя и Божией Матери из иконостаса храма находятся в Вознесенском кафедральном соборе г. Новосибирска. Пожар стал поводом для фактического прекращения деятельности православного прихода. Согласно архивным данным, уполномоченный Совета по делам религий К.Т. Иванов сообщил, что «здание церкви в селе Шипуново Сузунского района Новосибирской области по вине исполнительного органа и священника Синерукова сгорело. В связи с этим договор с религиозным обществом расторгнут, акт об этом подписали все члены церковной «двадцатки». Религиозное общество прекратило своё существование».
В бывшей церковно-приходской школе длительное время находился клуб. В 1970-е г.г. обветшавшее здание было снесено.
Штат Вознесенской церкви состоял из одного священника и одного псаломщика. Доподлинно неизвестно, кто был первым настоятелем; но имена некоторых священников и псаломщиков, в разные годы трудившихся в храме, уже установлены. Священники: Василий Стуков (1901-1913 г.г.), Илия Попов (1913-1914 г.г.; в 1918 г. убит красными партизанами), Петр Шебалин (1914-1920 гг.), Хрисанф Викторов (1920-1921 г.г.), Михаил Шелютто (с 1921 г.), Павел Бровченко (1920-е г.г., служил до ареста в 1930 г.), Антоний Кириллов (с 1930 г.). После открытия храма в 1945 г. в нем служили: Иоанн Мальцев (сентябрь-ноябрь 1945 г.), Иаков Курносов (с 1946 г.), Евфимий Синеруков (до 1964 г.). Псаломщики: Иоанн Пасшак (1909-1911 г.г.), Димитрий Моцартов (июнь-август 1911 г.), Иннокентий Невский (1911-1918 г.г.), Владимир Политов (май-ноябрь 1918 г.), Виктор Синявский (с 1918 г.), Григорий Дворянов (1920-е г.г.).
Одним из первых священников Вознесенской церкви являлся отец Василий Стуков. Василий Филаретович Стуков родился около 1875 г. Окончил Томское Духовное училище. 1 сентября 1890 г. определен псаломщиком. 12 октября 1897 г. псаломщик Василий Стуков был рукоположен в диакона, а 22 ноября 1898 г. — в священника. В 1901 г. священник Василий Стуков получил назначение к Вознесенской церкви с. Шипуновского. Спустя 12 лет, в 1913 г., отец Василий был переведен к Петропавловской церкви с. Шаховского Барнаульского уезда. В 1919 г. состоял священником церкви с. Волчно-Бурлинского, затем — Михаило-Архангельской церкви г. Камня. Известно, что около 1927 г. Василий Стуков состоял при церкви с. Заковряшинского.
http://www.orthedu.ru/kraeved/1988-xramy-suzunskogo-rajona.html
В 1936 г. церковь Вознесения Господня закрыли, в ней разместили зерносклад. Решением Совета от 21/II-45 г. храм вновь был открыт. В «Списке церковных зданий недействующих православных церквей, находящихся в Новосибирской области и г. Новосибирске на 1 июня 1945 года», составленном уполномоченным по делам Русской Православной Церкви, указано, о состоянии здания сказано следующее: «Глуб. перевалочный пункт Заготзерно. Здание деревянное прочное, купола, колокольня, кресты сохранились, внутри церковного оборудования и утвари нет».
Источник: ГАНО. Ф. Р-1418. Оп. 1. Д. 15. Л. 53-60.
