В 2004 году жители микрорайона Шереметьевский подали прошение в Долгопрудненско-Химкинское благочиние о строительстве часовни. В ноябре 2004 года в районе предполагаемой стройплощадки была размещена бытовка-вагончик, возле которой расположили информационный стенд с надписью «Строительство православной часовни от Спасского храма в Котово города Долгопрудного».
Храм-часовня строилась по проекту архитектора-реставратора Овчинниковой Вероники Викторовны. Ему дали посвящение во имя Покрова Пресвятой Богородицы. Как сообщалось в газете «Долгие Пруды», ранее в этих местах уже существовала часовня на Покровском погосте, но в 1930-е годы она была разрушена. Теперь название Покровскому приходу возвращено». С 1 марта 2013 года — самостоятельный приход. Однако храм начали перестраивать, даже не открыв. Заново были отремонтирована крыша и укреплены стены и фундамент.
Первое богослужение в храме Покрова Пресвятой Богородицы состоялось на Крещение 19 января 2008 года. Роспись стен выполнена группой художников из Владимира. Проект стенной живописи, дополненный небольшим иконостасом с иконами на тему христианских праздников, написанные в византийском стиле, был разработан настоятелем храма Александром Хоснутдиновым. Великое освящение храма состоялось 14 октября 2013 года. В 2015-2016 гг. сооружение было расширено за счёт пристроенных притворов с северной и южной сторон.
