Монастырь основан в конце 15-го века постриженником Воскресенского Череповецкого монастыря Севастьяном. Первая часовня срублена им самостоятельно. Со временем люди, привлеченные подвижничеством святого Севастьяна, прозванного к тому времени Сохотским, стали селиться подле него, образовывая таким образом общежитие, которое и послужило базой для основания монастыря. С 1622 года обитель была приписана к Череповецкому Воскресенскому монастырю. В 1764 году Сохотский монастырь был упразднен. На момент закрытия к монастырю было приписано всего 3 души, т.к. из-за местоположения среди глухих лесов и болот обитель была всегда крайне бедна. С момента закрытия и до середины XIX века на этом месте находилась часовня. В 1889 году возрожден в виде Севастьянова Сохотского Спасо-Преображенского женского монастыря. В 1910 году построен каменный храм. Разрушен в 1930 году. На момент закрытия и разрушения в монастыре насчитывалось 130 монахинь. В советское время на месте обители находился поселок лесорубов Сохоть, ныне пропавший.