Одним из важнейших исторических периодов русского дипломатического присутствия в Святой Земле, стало возникновение Российского генерального консульства в Иерусалиме. Российское дипломатическое представительство в Святом Граде, возникает в 1858 году. Если доставкой паломников в Святую Землю поначалу занималось Российской Общество пароходства и торговли (РОПИТ), для чего в Иерусалиме было открыто его агентство РОПИТа. То после возникновения в 1882 году ИППО, доставкой и бытом паломников стало заниматься Императорское Православное Палестинское Общество (ИППО). И если в 1858 году на Пасху в Иерусалим прибывало до 800 паломников, то на Пасху 1912 года в Иерусалиме побывало уже около 6 тысяч человек. Такое возрастающее и активное движение паломников в Иерусалим, требовало постоянного консульского присутствия России непосредственно в Иерусалиме. И уже в 1858 году для это были приняты все необходимые меры.
Так министр иностранных дел Российской Империи, А.М. Горчаков в докладе Императору Александру II, 19 апреля 1858 года, делает особое представление по этому вопросу и предлагает поручить исполнение должности русского консула в Иерусалиме агенту РОПИТа В.И. Доргобужинову. А уже 13-14 декабря 1858 года, Император Александр II утверждает предложение Горчакова. В результате этих обстоятельств, в декабре 1858 года в Иерусалиме возникает Российское консульство, на первых порах состоящее из двух штатных единиц: консула и секретаря.
Российский посланник в Константинополе А. П. Бутенев, утвердил особую инструкцию, в рамках которой В. И. Доргобужинов был обязан осуществлять надзор за русскими паломниками, оказывая им необходимое содействие, поддерживать прямые отношения с турецкими властями и консулами других иностранных государств. Также согласно этой инструкции, Российскому консульству было предоставлено право действовать в решении практических вопросов самому, по соглашению с начальником Русской Духовной Миссии в Иерусалиме, а в случае особой необходимости обращаться непосредственно к посланнику в Константинополе. Для целей основания постоянного здания для Российского консульства в Иерусалиме, В.И. Доргобужиновым было специально приобретен участок земли для планируемого будущего Российского Императорского консульства в старом городе Иерусалиме, недалеко от Храма Гроба Господня еще в 1859 году.
Однако при освоении участка были обнаружены археологические древности и Порог Судных Врат. Участок консервируется и впоследствии передается в ведение Императорского Православного Палестинского Общества, где в будущем строится Александровское подворье ИППО.
Исходя из сложившейся ситуации, участок под Российское консульство был выделен на Мейданской площади и был построен а рамках общего строительства Русских построек на Русском подворье в центре западного Иерусалима на Мейданской площади в период с 1859 по 1864 гг.
Начиная с 1879 года, Российское консульство в Иерусалиме возглавляется генеральными консулами, а во второй половине 1891 года статус консульства повышается до уровня Генерального Императорского Российского консульства в Иерусалиме. До 1878 года русские консулы в Иерусалиме, кроме дипломатической государственной службы совмещали также должность агентов РОПиТ.
Наиболее успешный период действия Российского Императорского Генерального консульства в Иерусалиме длился вплоть до 1914 года, и особенно плодотворно и ярко, в период каденции генконсула А.Г. Яковлева (1897-1907 годы). С 1914 года, в виду начавшейся войны, в которой Османская империя воевала против Императорской России, дипломаты консульства вынуждены были покинули помещения консульства и эвакуировались в Египет. После этих трагических обстоятельств Российское дипломатические присутствие в Иерусалиме прекратила свое существование. Турецкие войска занимают здание Русского консульства в 1914 году, а в 1917 году, британские мандатные власти над Палестиной, устраивают на территории консульства свой административный корпус.
Политику Британских властей в отношении русских построек продолжают в 1948 году власти созданного в этом же году государства Израиль. Здание Русского консульства занимают израильские власти, и сдают помещения различным арендаторам.
В 1964 году здание Русского генерального консульства в Иерусалиме было продано советским правительством в рамках «апельсиновой сделки». Законность этой сделки до сих пор оспаривается современными историками.
На сегодняшний день здание Российского Императорского генерального консульства занимают различные отделы городского муниципалитета города Иерусалима.
На фасаде основного входа в здание с западной стороны, сохранилась историческая каменная таблица XIX века с барельефными заглавными буквами и римскими цифрой — Н II – аббревиатура последнего Российского Императора — Николая II.