Первая колокольня при Спасском соборе была построена в XVI веке. Располагалась она в северо-западном углу галереи. В первом ярусе колокольни находился храм во имя Трех Святителей: Василия Великого, Григория Богослова и Константинопольского патриарха Иоанна Златоуста. Над церковью располагался открытый ярус звона, на который вела частично сохранившаяся до нашего времени в толще стены узкая лестница. В 1720 году старая церковь-колокольня была почти полностью разобрана, а колокола перенесены на новую. К настоящему времени от старой колокольни сохранилась только нижняя часть – подклет и первый ярус восьмигранного столпа, перекрытый сводом.
Между 1644 и 1656 годами рядом с церковью-колокольней Трех святителей выстроена новая, более высокая колокольня. С западной стороны к новой колокольне примыкает невысокая пристройка – церковь Алексия, человека Божиего. Таким образом, новая колокольня также, как и старая, была призвана совмещать функции колокольни и храма. Стоит отметить, что оба престола старой и новой колокольни упразднены еще в дореволюционный период.
Первоначально колокольня, выстроенная в традициях середины XVII века, была шатрового типа. Ее широкая нижняя часть – подклет с двумя кельями и двухъярусный четверик – декорирована скромными наличниками, плоскими лопатками и поясом кокошников по границе между двумя ярусами. Поставленный выше восьмерик сразу переходит в открытый ярус звона с арочными проемами. Прежнее шатровое завершение снято в 1720-е годы, при этом стены звона надложены, и на них водружен еще один восьмерик, в котором были поставлены большие колесные часы с боем (не сохранились).
В 1736 году на новой колокольне было восемнадцать колоколов. Большой колокол весом 357 пудов 30 фунтов и Вестовой колокол весом 55 пудов с изображением князей Дмитрия и Ивана Углицких, отлиты в 1736-1738 годах белозерским посадским человеком Иваном Калиновичем Коркуцким. В 1930-е годы колокола были пущены на переплавку. В конце XVIII века верхний восьмерик получил завершение в виде фигурной кровли, завершающейся небольшим шпилем. В 1841 году крестьянин Михайло Горин сделал на колокольне и новый шпиль, который просуществовал до середины ХХ века.
В 1967-1968 годах колокольня реставрировалась: исправлена кладка стен, они были отштукатурены и побелены. Тогда же завершение колокольни было надстроено еще одним четвериком, завершенное луковичной формой.
В 2007 году для Спасского собора на средства Клуба делового общения города Вологды были отлиты 14 колоколов. Тогда же их водрузили на колокольню. В августе 2008 года в монастыре освящен и поднят на звонницу главный колокол. Его изготовили в г. Тутаеве Ярославской области. Самый большой колокол Спасо-Прилуцкой звонницы весит 1640 килограммов. На его изготовление ушло около 9 месяцев и примерно миллион рублей. Новые колокола – это важный, но лишь очередной этап возрождения духовной жизни монастыря, который является культурным центром не только Вологды, но и всей России.
Источник: Вологда: монастыри и храмы города
Одновременно со Спасским собором была выстроена колокольня в 1537-1542 гг. с престолом в нижнем ярусе в честь Трёх Святителей. Буквально через сотню лет эту колокольню разобрали. Колокольня, которую видят сегодня гости монастыря, была построена в 1639-54 годах. До этого на её месте стояла другая, возведённая одновременно с каменным Спасским собором. Согласно традиции той эпохи, это была шатровая постройка типа «восьмерик на четверике». В нижнем двухъярусным четверике, декорированном скромными наличниками, плоскими лопатками и поясом кокошников по границе между двумя ярусами, находились две кельи. Поставленный выше восьмерик сразу переходит в открытый ярус звона с арочными проёмами, украшенными килевидными архивольтами. Узорчатые карнизы колокольни и килевидные арки находят отклик в декоративных поясках монастырских церквей. Прежнее шатровое завершение было снято в 1720-е годы, при этом стены звона надложены и на них водружён ещё один восьмерик в стиле «московского барокко», в котором были установлены большие колёсные часы с боем. В конце ХVIII века верхний восьмерик получил завершение в виде фигурной кровли со шпилем. В 1841 году вологодский крестьянин Михаил Горин выполнил и установил на колокольне новый шпиль, который просуществовал до сер. ХХ века. Колокола Спасо-Прилуцкого монастыря, отлитые в 1736-38 годах, были пущены в разгар индустриализации на переплавку в 1935 году. От них не осталось почти ничего — ни описаний, ни эскизов. Известны лишь имена некоторых колоколов («Вестовой», «Протас», «Большой») и их вес. Так, колокол «Большой» (действительно, самый тяжёлый из всей звонницы) весил 357 пудов 30 фунтов, «Вестовой» — 55 пудов.
В 2007 году колокольня получила новую звонницу. Составленная по образцу звонницы Софийского собора, она насчитывает 14 колоколов, вес самого крупного из которых достигает 600 килограммов. В августе 2008 года был освящён и поднят на звонницу главный колокол весом 1640 килограммов. Его изготовили в г. Тутаеве Ярославской области на средства благотворителей и попечителей Спасо-Прилуцкой обители. На его изготовление ушло около 9 месяцев и около миллиона рублей. В 1967-1968 годы монастырская колокольня реставрировалась специалистами Вологодской специальной научно-реставрационной мастерской под руководством советского архитектора Глеба Павловича Белова. В ходе этих реставрационных работ была исправлена кладка стен, они были оштукатурены и побелены; завершение колокольни было восстановлено по проекту начала ХVIII века и покрыто листами из оцинкованного железа, установлена луковичная главка. «Попробовала свои силы» новая звонница Спасо-Прилуцкого монастыря 16 июня 2007 года, когда на праздник Сретения чудотворного образа прп. Димитрия Прилуцкого в Вологду прибыл Святейший Патриарх Алексий II.
Из журнала «Православные монастыри. Путешествие по святым местам». Выпуск №11, 2009 г.