Церковь Покрова Божией Матери в селе Покровское-Засекино построена в 1593 г. на вотчинной земле князей Шуйских. С 1638 по 1678 г.г. церковь была уничтожена и церковная земля отдавалась на оброк. В 1678 г. окольничий И. А. Прончищев построил церковь Покрова Божией Матери в селе Покровское.
В 1690 г. село Покровское продано князю М. Ф. Жировому-Засекину. В 1715 г. владельцами села были сыновья М. Ф. Жирового-Засекина, а с 1757 по 1762 г.г. его внук – Ф. Н. Жировой-Засекин, от которых село Покровское получило название Покровское-Засекино.
В августе 1770 г. церковь с приделом святителя Николая Чудотворца в этом селе сгорела от удара молнии, а церковная утварь была спасена священником. В 1773 г. вместо сгоревшей, князь Мещерский (племянник Ф. Н. Жирового-Засекина) построил новую деревянную церковь и, по указу Московской Духовной Консистории, она была освящена прежним названием – церковь Покрова Божией Матери с приделом святителя Николая Чудотворца.
Следующая, но уже кирпичная церковь Покрова Божией Матери с приделами святителя Николая Чудотворца и святого благоверного великого князя Александра Невского построена в 1887 г. в усадьбе Покровское-Засекино на средства помещицы Н. Г. Дебриньи и прихожан. Церковь была украшена куполами, крестами, настенной росписью, с богатой церковной утварью. По данным 1910 г. храм оценён вместе с иконостасом в 6500 рублей.
Здание церкви было кирпичным неоштукатуренным на белокаменном цоколе, выполнено в стиле эклектики с использованием форм и элементов декоративного убранства древнерусской архитектуры. Продольно-осевая композиция храма состояла из двусветного четверика с трёхлопастной апсидой, прямоугольной трапезной и колокольни.
В 1932 г. церковь была закрыта и разграблена.
В 1941 г. в здании церкви находился штаб Западного фронта, с 1943 по 1945 г.г. – лечебное учреждение для армии.
С 1947 по 2003 г.г. здание храма использовалось под штаб 79-й воинской (пожарно-технической) школы младших специалистов Министерства обороны РФ.
При приспособлении храма под штаб войсковой части здание претерпело большие изменения: утрачены световой барабан с главкой, верхний восьмигранный ярус звона колокольни с шатровым завершением, западная белокаменная лестница; разобраны своды и поддерживающие столбы трапезной. Пространственная структура церкви нарушена междуэтажными перекрытиями и многочисленными перегородками. Трапезная часть храма надстроена вторым этажом.
Храм открыт с 2003 г. С этого времени начались регулярные богослужения.
В настоящее время ведутся работы по восстановлению храма. Над трапезной частью церкви снесён второй этаж. Храм обрёл купол с крестом. Внутри здания разобраны междуэтажные перегородки и перекрытия.
Существовавшая ранее церковь Покрова Пресвятой Богородицы в селе Покровском.
Церковь Покрова Пресвятой Богородицы в 1593 г. находилась на погосте у сельца Симановского, близ села Раева, Звенигородского уезда, на вотчинной земле князей Ивана Михайловича и Ивана Андреевича Шуйских. В начале XVII ст. Покровская церковь была уничтожена, и погост назван пустошью.
По писцовым книгам 1624 – 25 гг. Звенигородского уезда Городского стана значится: «за боярином князем Иваном Ивановичем Шуйским в вотчине село Раево, а в селе двор боярский и 5 дворов крестьянских, людей в них 30 человек; пустошь, что был погост Покровский на земле вотчинной, а на погосте место церковное Покрова Святой Богородицы; пашни церковные земли 18 четвертей в поле».
Церковная Покровская земля с 1638 – 78 гг. отдавалась на оброк и писалась в приходных окладных книгах в числе церковных оброчных земель, под Звенигородскою десятиною. В 1679 г. церковная Покровская земля была исключена из приходных оброчных книг со следующей отметкой: «на сей церковной земле в 1678 г. окольничий Иван Афанасьевич Прончищев построил церковь Покрова Богородицы и та церковь обложена данью и впредь сей земли не писать». Обложенная данью Покровская церковь писалась в приходных книгах Патриаршего Казенного Приказа в числе «жилых церквей», под Звенигородскою десятиною, с 1679 по 1711 гг.: «церковь Покрова Пресвятой Богородицы на погосте окольничего Ивана Афанасьевича Прончищева в селе Покровском…».
Из переписных книг 1678 г. в селе стояли «двор вотчинников, двор прикащиков и двор скотный, в котором жили 13 человек деловых людей; в деревне Раевской – 4 двора деловых людей, 4 двора крестьянских и 2 двора бобыльских, в них всего 45 человек».
В 1690 г. жена И. А. Прончищева вдова Пелагея Ивановна продала село Покровское князю Михаилу Федоровичу Жировому-Засекину и за ним записано в переписных книгах 1705 г.: «двор попа Семена Федорова, во дворе дьячок Василий Микифоров, двор скотный, в селе и деревне 16 дворов крестьянских, в них всего 67 человек». Владельцами села Покровского после князя М. Ф. Жирового-Засекина были в 1715 г. его сын князь Никита Михайлович, а в 1757 – 62 гг. внук его князь Федор Никитич Жировой-Засекин, от которых село Покровское и получило придаточное название «Засекино».
Холмогоров В. И., Холмогоров Г. И. «Исторические материалы для составления церковных летописей Московской епархии». Выпуск 2, Звенигородская десятина. Москва. Типография Л. Ф. Снегирева, 1881 г.