Магдала считается местом происхождения святой Марии, ученицы Христа и мироносицы. Подворье расположено в Галилее, на западном берегу Тивериадского озера, называемом Магдала, в районе горы Арбель.
На подворье располагается большой сад с грейпфрутовыми деревьями, а также природные источники с целебной водой: теплый родоновый, «Глазной» и тот источник, около которого, согласно преданию, Иисус Христос исцелил Марию Магдалину.
Место рождения Марии Магдалины стало объектом паломничества ещё в средние века, со времени Византийской империи. Здесь была построена церковь, которая позднее, предположительно, от рук сарацин была разрушена. При крестоносцах церковь была восстановлена. О ней упоминает русский игумен Даниил.
В 1908 году архимандритом Леонидом (Сенцовым) был приобретён большой участок земли на побережье Галилейского моря с источником святой Марии Магдалины. Как отмечал архимандрит Леонид, «близ Тиверии вновь приобретён большой участок на берегу Тивериадского озера с минеральными источниками, где рассаживается апельсиновый сад и предполагается выстроить храм и барак для поклонников. Это место представляет собой чудный оазис на пустынных берегах озера».
Первая мировая война помешала строительству храма во имя святой Марии Магдалины. На участке в Магдале в одном из домов была устроена временная часовня. В непростые для Русской Духовной Миссии послереволюционные годы часть земли и дом сдавались в аренду. После образования государства Израиль, объект перешёл в ведения Русской духовной миссии Московского патриархата. Магдальский сад был обновлен.
В 1962 году при начальнике РДМ архимандрите Никодиме (Ротове), на участке была построена небольшая церковь во имя святой Марии Магдалины. В 1996 году в храме была проведена наружная и внутренняя реставрация. К Пасхе 1997 года стены внутри храма были расписаны фресками в византийском стиле на евангельские темы московским художником Ярославом Добрыниным. Они были связаны с Галилейским морем. В храме также был устроен новый деревянный иконостас.
В июне 1997 года Патриарх Московский и Всея Руси Алексий II заложил здесь первый камень «Дома для паломников», построенного впоследствии к 2000-летию христианства. Небольшая гостиница для паломников действует по сегодняшний день. В 1998 году стараниями архимандрита Феодосия (Васнева) на участке в Магдале был построен новый дом для приема паломников.
Подворье является закрытым объектом. Посетить его можно только по благословению и по предварительной договоренности. Это сделано с целью оградить тихую жизнь подворья от зевак, так как оно расположено у дороги, по которой проходят многочисленные экскурсионные туры.
