Первые шаги по строительству храма были предприняты в 1996 г. При активном содействии губернатора Игоря Фархутдинова, мэрия города Южно‐Сахалинска предоставила Южно‐Сахалинской и Курильской епархии участок земли для проектирования храмового комплекса. Однако приступить к строительству не удавалось еще несколько лет.
Первый этап подготовительных работ начался осенью 2003 года. К осени 2004 г. было определено строить на этом месте деревянный храм в честь святителя Николая архиепископа Мир Ликийских Чудотворца. 19 декабря в день памяти святителя Николая был отслужен молебен, а затем состоялось освящение строительства. Этот день можно считать рождением нового прихода.
Храм собирали из деревянного бруса, недостающую часть которого, поставили Тымовские лесопромышленные предприятия, как благотворительную помощь.
Первого апреля 2005 г., в недостроенном храме была отслужена первая Божественная Литургия.
Во второй половине апреля основная часть работ была завершена, и в храм был направлен священник.
В храме стали регулярно проходить службы и совершаться требы, росла и укреплялась община. Внутреннее обустройство храма продолжилось. Были изготовлены и установлены двухъярусный иконостас, левый и правый клиросы. Храм украсили резьбой по дереву.
В 2005 г. в храме начала работать воскресная школа. В этом же году началось строительство отдельного здания для школы.
В 2008 г. храму были подарены икона Царственных мучеников и икона Пресвятой Богородицы, именуемая «Державная».
22 июля 2009 г. приход святителя Николая архиепископа Мир Ликийских получил государственную регистрацию.
Сегодня храм святителя Николая занимает значительное место в жизни его прихожан и всего города. В нем регулярно проходят богослужения. Священники и прихожане храма проявляют заботу и внимание о проживающих по близости инвалидах и престарелых людях. Посещают школы и больницы, ближайшую воинскую часть.
Территория храма благоустроена, на ней расположена звонница, небольшой сквер с фонтаном, детская площадка, на которую родители и дети с удовольствием приходят погулять. Привлекательная архитектура деревянного храма в традиционном русском стиле является украшением города и его достопримечательностью.
