Важнейшей артерией рыбинского края была река Черемуха. В XVII-XVIII веках земли к юго-востоку от Рыбной слободы именовались Черемошской волостью или Черемхой. Здесь, по берегам реки и ее притоков располагались села и погосты, где до сих пор встречаются памятники каменного и деревянного зодчества. В десяти километрах от Рыбинска, на холме, у впадения в Черемуху речушки Йоды, расположено село Михайловское. Отсюда, направившись по старому, ныне полузаброшенному тракту на Большое село, можно, преодолев еще около десяти километров проселочной дороги, добраться до села Александрова пустынь. Здесь сохранился самый древний памятник Рыбинского района — каменная церковь Троицы, возведенная около 1678 года. Некогда она служила храмом небольшого затерянного в лесах монастыря, известного уже в эпоху Ивана Грозного. Помимо нее во второй половине XVII века в монастыре существовали деревянные церкви Онуфрия Великого и Успения Богоматери с приделом Михаила Архангела. Ансамбль дополняла деревянная шатровая колокольня. В XVIII веке обе деревянные церкви были разобраны. В 1764 году и сам монастырь был упразднен, а его каменная церковь превращена в обычный приходской храм.
Троицкая церковь дошла до наших дней с большими потерями. Сохранился лишь ее основной объем — сильно вытянутый по оси север-юг высокий четверик, перекрытый лотковым сводом, на котором установлены три небольших шатра. Изначально храм имел большую трехапсидную алтарную часть и двустолпную трапезную. К северо-западному углу трапезной примыкала шатровая колокольня. В конце XVIII века у северной стены трапезной был построен придел в честь Михаила Архангела, частью которого стал нижний ярус колокольни. В первой половине XIX века к западному фасаду трапезной была пристроена паперть; пол храма был выложен чугунными плитами, закрывшими древний кирпичный настил.
По своему объемно-композиционному решению Троицкая церковь принадлежит к распространившемуся уже в первой половине XVI веке типу монастырских трапезных церквей. Помещение трапезной использовалось по прямому назначению — как место братской трапезы, на которой присутствовали все иноки. Позднее, когда монастырь был закрыт, она стала служить теплой зимней церковью. Особенно удобными трапезные церкви были в зимнее время, когда тепло, поступавшее из трапезной, обогревало и самый храм. Такие трапезные в XVI-XVII веках обычно строились двухэтажными, что давало возможность для размещения внизу хозяйственных помещений и кухни. Однако бедный лесной монастырь, видимо, не имел достаточно средств для возведения двухэтажного каменного здания.
Внешнее убранство Троицкой церкви отличается необычном для второй половины XVII века суровым лаконизмом. Плоскости фасадов оживляют лишь широкие угловые лопатки, узкие, как бойницы, окна и небольшие квадратные ниши киотов. Три невысоких, тесно сдвинутых шатра выглядят несоразмерно малыми по сравнению с громадой основного объема. Однако прежде — до утраты трапезной, колокольни, алтарных апсид — соотношение различных частей здания было иным. Прежний облик Троицкой церкви запечатлел в своих рисунках известный ярославский краевед И.А. Тихомиров, побывавший в Александровой пустыни в конце XIX века. Правильное представление об изначальном виде Троицкой церкви может дать и типологические очень близкая к ней трехшатровая церковь Владимирской Богоматери в Ярославле.
