Первые известия о Георгиевском храме с. Филатове относятся к последней четверти XVIII в. И селе в это время насчитывалось 263 двора, в которых переписью было зафиксировано 405 душ мужского пола однодворцев и 415 душ малороссиян, живущих своими дворами (на положении государственных крестьян).
«Справочная книга о церквах…» 1909 г. относит время постройки храма к 1783 г., но это было не первое его здание, так как имеются сведения о том, что метрические книги по части прихода заведены с 1774 г. До 1903 г. в приход Георгиевского храма входила д. Долженково. В клировой ведомости церкви отмечено, что ее деревянное здание, хотя и возобновлялось дважды, в 1870 и 1887 гг., уже обветшало, и в мае 1905 г. строительное отделение губернского правления утвердило проект нового здания. В архиве имеется подробная объяснительная записка к проекту (чертежа, к сожалению, нет) с указанием всех размеров, толщины стен, описанием сводов, фронтонов, глав, арочных проемов и пр. Строительство затянулось и завершилось лишь в 1918 г. Новое здание было каменное, одноэтажное, оштукатуренное п окрашенное, холодное, с пятью главами, крытыми железом, с железными гладкими крестами, окон – 33, с решетками. Одновременно была построена и колокольня, каменная, в два яруса, с шестью колоколами: 147 пудов (разбит), 60 пудов, 35 пудов, 29 фунтов, 1 пуд 6 фунтов, 30 фунтов. Паперть открытая, с навесом на каменных столбах. Престол в храме один, во имя св. великомученика Георгия Победоносца. Иконостас фаянсовый, исполнен в 1917 г., двухъярусный, размером 16 аршин, с 29 иконами. Как видно из клировой ведомости 1916 г., в это время в селе было 269 крестьянских дворов (977 муж., 1034 жен.) и 2 двора духовенства (5 муж., 10 жен.). Церковь имела землю: усадебную вместе с погостом 4 десятин, пахотную 52 десятин. С 1893 г. при храме была открыта церковно-приходская школа, одноклассная. Она имела собственное здание, в 1916 г. в ней обучалось 49 мальчиков, 12 девочек. В библиотеке имелось 85 книг.
Ближайшими к храму были церкви: Георгиевская с. Долженково в 1 версте, Афанасьевская с. Нижнее Бабино в 4 верстах, Рождество-Богородичная с. Бегичево в 3 верстах, Троицкая с. Кривицкие Буды Суджанского уезда в 5 верстах.
В 1922 г. из храма изъято 7 предметов богослужебного назначения (священные сосуды, крест) общим весом 3 фунта 93 золотника. Решением президиума облисполкома от 05.08.1940 г. храм был закрыт как не функционирующий с 1932 г., община распалась. Предусматривалось использование здания в культурных целях.
Во время Великой Отечественной войны богослужения в храме возобновились. С декабря 1941 г. священником здесь был Преображенский Николай Николаевич, отдавший много лет жизни службе в этом приходе. При нем происходило строительство Георгиевского храма в начале века, он служил в нем в сложные для русской православной церкви 1920-е гг. и в трудную военную годину вернулся к своей пастве. В августе 1944 г. религиозное объединение в с. Филатово было зарегистрировано органами власти. Народ обратился к вере. Посещаемость храма, особенно в праздничные дни, достигала 1000 человек.
В 1951 г. Обоянский райисполком возбудил ходатайство о запрещении использования здания в связи с его технической неисправностью, но храм продолжал действовать. Богослужения прекратились в августе 1963 г. из-за отсутствия священника, уехавшего из села. Активисты общины обратились к епископу с просьбой направить священника. Но на решение этого вопроса ушло много времени, лишь в 1967 г. храм вернулся в число действующих и оставался таковым в течение 1970-1980 гг., хотя перерывы в богослужениях бывали и в это время, но не такие длительные.
Постановлением губернатора Курской области № 566 от 30.10.1998 г. Свято-Георгиевский храм поставлен на охрану как памятник культовой архитектуры регионального значения.
