Исторических сведений о храме не много. В древности на месте села, на левом берегу р. Пекши, находился Архангельский погост с храмом в честь Архистратига Михаила. В середине XVIII века погост исчез окончательно, возникшая на его месте д. Арханино, Архангелка, слилась с д. Анкудиново. На топографической межевой карте Владимирской губернии Александра Ивановича Менде, который с 1849 года по 1866 год руководил топографическими и картографическими работами в центральных губерниях Российской Империи, обозначено селение Архангелъ.
По одной из версий, в 1867 году купец Григорий Белов построил здесь каменную церковь Архистратига Михаила, она была приписана к церкви с. Алексино. Богослужения совершались причтом Алексинской церкви в воскресные и праздничные дни. По другой версии, храм был построен на средства помещика Муханова, рядом с помещичьим домом. Что подтолкнуло его на строительство, неизвестно. Храм был изначально приходским. Фамилия Муханов встречается и сейчас среди жителей сел Анкудинова и Логинцева, не исключено, что это потомки предполагаемого строителя храма. А улица, примыкающая к храму, по сей день носит имя Арханинская. Судя по упрощенной архитектуре в стиле классицизма и небольшим размерам, работы велись местными жителями без привлечения архитектора и наемных рабочих, это подтверждает и неровная кладка храма. С запада к трапезной ранее примыкала колокольня, в настоящее время утраченная. По словам жителей села, она разрушена в тридцатых годах двадцатого века по распоряжению советских властей.
При церкви с. Анкудиново была открыта церковно-приходская школа. Учителем был Петр Петрович Каллиопин, в 1894 году он окончил Владимирскую духовную семинарию.
Примечательно, что в соседней деревне Логинцево, примерно в те же времена, была заложена часовня. По словам Игоря Сергеевича Голубева, родом из д. Логинцева, в строительстве часовни принимал участие его прадедушка — Дмитрий Яковлевич, а эта часовня и Михайловская церковь в Арханине-Анкудинове, возможно, освящались одними и теми же священниками.
В советское время помещичий дом использовался как приют для бездомных детей, а храм был переоборудован под столовую. Когда дом стал требовать капитальных вложений для ремонта, приют перевели. А обветшавшую столовую-храм со временем переоборудовали в гвоздильный цех. В состоянии разваленного гвоздильного цеха храм был передан Русской Православной церкви. В 1990-х годах община верующих начала восстановление храма. В настоящее время восстановление храма продолжается, богослужения проводятся регулярно.
