В 1998 году по многочисленным просьбам и предложениям студентов и преподавателей в Курском государственном педагогическом университете была создана православная община во имя Святых равноапостольных Мефодия и Кирилла. Сразу же было принято решение о строительстве храма в честь святых просветителей славян в живописном дворике вуза. Строительство храма при главном и старейшем вузе региона планировалось как создание духовно-просветительского центра молодежи города и области.
Инициатива строительства университетской церкви принадлежит заслуженному скульптору РФ Вячеславу Клыкову, создавшему эскиз будущего храма.
Тогда же, 24 мая 1998 года архиепископ Курский и Рыльский Ювеналий совершил закладку камня на месте будущего строительства храма. Проект храма был разработан зодчими и конструкторами творческой мастерской архитектора Валерия Михайлова.
На Вербное Воскресение в 1999 году настоятелем было совершено освящение престола в домовой церкви, которая располагалась на первом этаже главного корпуса в аудитории № 36.
В период с 1999 года по 2007 шли строительные работы. В 2008 году к празднику святой Пасхи был изготовлен и установлен Свято-Троицким братством города Щигры великолепный иконостас. В этом же, 2008 году 24 мая, в праздник святых равноапостольных Мефодия и Кирилла Его Высокопреосвященство, архиепископ Курский и Рыльский Герман, совершил Великое освящение храма.
