В январе 2010 года, рядом с новым Кафедральным собором во имя Благовещения Пресвятой Богородицы, закончили строительство и освятили вновь отстроенную Свято-Никольскую церковь в честь той самой деревянной «Свято-Никольской церкви — первого дома Благовещенска» 1857 года постройки.
В середине XIX века Амурская область вошла в состав Камчатской епархии, и центр духовной жизни всего Дальнего Востока сосредоточился в Благовещенске. В новом городе, как и полагается, строились церкви: вначале деревянные, затем каменные. И самая первая церковь была посвящена Святителю Николаю, Мирликийскому Чудотворцу. Первый храм Благовещенска и первый дом нового города был построен на самом возвышенном месте по инициативе священника Александра Сизого. Он построил его вместе с солдатами линейного батальона за одну ночь и на следующий день освятил.
Случилось это в 1857 году. Строили часовню из брёвен «мертвокладной», в которой минувшей зимой хранились тела умерших казаков Усть-Зейского поста. Через год к часовне сделали пристройку. А ещё через год достроили колокольню. До 1864 года Свято-Никольская церковь служила и Кафедральным собором, то есть главным храмом, в котором служит архиерей. Пока не был построен и освящён новый Кафедральный собор.