Храм в честь Страстей Господних неизвестен большинству горожан, вследствие гонений на Церковь в советский период, хотя его история сопоставима с историей Саратова. Еще в допетровское время на этом месте, перекресток современных улиц Московской и Октябрьской, которое тогда находилось вне стен крепости, была построена часовня. Время ее возведения неизвестно, первое документальное упоминание о ней относится к апрелю 1696 года.
В 1827 году уже перестроенная из деревянной в каменную часовня обращается в церковь и освящается. В 1860 году после очередной перестройки с целью ее расширения, церковь была освящена в честь Страстей Господних, а в 1866 году в ней освящен придел в честь Иверской иконы Божией Матери. Так как она была приписана к Спасо-Преображенскому мужскому монастырю и служили в ней монахи, то в народе ее называли просто Киновия, с др. греч. «общежитие».
Уже к середине ХIХ века храм находился в самом центре Саратова. Он был богато украшен благотворителями, дорогая утварь, священные облачения, иконы в сребропозлащенных окладах. Колокольни храм не имел, но 8 колоколов, из которых самый крупный весом примерно 690 кг, были подвешены на специальных столбах, с южной стороны здания.
После революции 1917 года церковь и подворье закрыли, здания перестроили и разгородили, затем здесь обосновался Дом Народного Творчества.
Позднее в здании была основана Саратовская студия «Союзкинохроника» а после Великой Отечественной войны, «Нижне-Волжская студия кинохроники».
С началом 1990-х годов, в результате сложного экономического положения в стране, студия сократила количество выпускаемой кинопродукции, а в 2002 году на студии начался процесс приватизации. Помещения сдавались арендаторам.
В 2012 году здание храма Страстей Господних было возвращено Саратовской епархии. 29 июля 2012 года в храме была совершена первая Божественная литургия.
В конце 2012 года в здании начали производиться масштабные ремонтно-восстановительные работы.
С июня 2014 года в храме в честь Страстей Господних возобновлены богослужения.
Каждое воскресение в 10:00 проходят Евангельские чтения, на которых разбирается глава из Евангелия.
В связи с началом масштабной реконструкции здания храма Страстей Господних, по благословению Митрополита Саратовского и Вольского Лонгина, в соседнем здании был оборудован временный храм.
10 марта 2017 года, Благочинный Троицкого округа священник Николай Генсицкий, в сослужении настоятеля храма и духовенства благочиния, совершил Чин положения Антиминса во временном храме. Затем была совершена Литургия Преждеосвященных Даров.