Несмотря на свой относительно малый возраст, Спасо-Преображенский кафедральный собор прошел большой и нелегкий путь становления, сумев завоевать славу главной архитектурной достопримечательности Абакана и любовь его жителей.
В 1994 г. администрацией г. Абакана был выделен участок земли под строительство Спасо-Преображенского собора.
Проект будущего храма, архитектором которого был Крылов А. В., разрабатывался институтом «Абакангражданпроект» под управлением главного инженера проекта Усова А. В.
В 1999 г. началось строительство собора. Главным спонсором стало крупнейшее предприятие Хакасии — Саянский алюминиевый завод (СаАЗ). Подрядчиком выступило ООО «Стройсервис».
27 мая 1999 г. епископ Абаканский и Кызылский Викентий освятил и заложил первый камень в основание строящегося собора.
19 августа 2001 г., в праздник Преображения Господня, в строящемся соборе состоялось освящение нижнего храма в честь новомучеников и исповедников Российских.
23 декабря 2001 г. состоялось малое освящение верхнего храма кафедрального собора в честь праздника Преображения Господня. Полное освящение было невозможно, так как не был закончен иконостас.
19 августа 2005 г., в год 10-летия Абаканской и Кызылской епархии, собором 4-архиереев совершилось великое освящение верхнего главного храма собора.
Через год, 19 августа 2006 г., в праздник Преображения Господня, был освящен основной иконостас, украшенный к этому времени позолоченной резьбой.
В 2006 году в верхнем храме были пристроены два боковых придела: левый придел в честь святителя Иннокентия, митрополита Московского, был освящен 6 октября 2006 г., правый придел был освящен в честь иконы Божией Матери «Неопалимая купина» 26 октября 2006 г.
Собор представляет собой классический 7-и купольный храм, выбеленный снаружи. Верхний храм имеет два боковых придела и классический 5-и ярусный иконостас, украшенный позолоченной резьбой. Нижний храм является крестильным храмом, в нем имеется баптистерий для совершения Крещения. Купола собора покрыты металлом с напылением сплава нитрит-титана. На колокольне имеется 12 колоколов. Самый большой колокол — 5670 кг. Общая площадь собора составляет 1637 квадратных метров, высота от земли до маковки колокольни — 49,2 метра, вместимость — до 1000 человек.
В соборе имеется ковчежец со святынями (часть Креста Господня, часть дуба Мамврийского, св. ап. и ев. Марка, преп. Германа Аляскинского, сщмч. Владимира, митр. Киевского, свт. Филарета, митр. Московского, преп. Герасима Иорданского, свт. Луки, архиеп. Красноярского, свт. Иоанна Хозевита, еп. Кесарийского, преп. Евфимия Великого, преп. Саввы Сторожевского, преп. Моисея Угрина, св. ап. Андрея Первозванного, свт. Николая, архиеп. Мирликийского, свт. Иоасафа Белгородского, св. блгв. вел. кн. Александра Невского, свт. Филиппа, митр. Московского, св. вмч. Анастасии Узорешительницы, свт. Иннокентия, митр. Московского, свт. Тихона, Патриарха Всероссийского, сщмч. Фаддея, архиеп. Тверского).
Кроме того, в соборе имеются иконы сибирских святых с частицами их святых мощей: свт. Иннокентия, митрополита Московского, свт. Иоанна, митрополита Тобольского, сщмч. Гермогена, епископа Тобольского, мученика Василия Мангазейского, св. прав. Феодора, старца Томского, св. блж. Матроны Московской.
Имеются также и другие святыни: камень с горы Фавор — места Преображения Господня, иконы Божией Матери «Скоропослушница» и «Отрада и Утешение», освященные на первообразах на Святой Горе Афон (Греция), икона Апокалипсиса, с частицей из пещеры Апокалипсиса на острове Патмос (Греция), икона свт. Николая, архиеп. Мирликийского, освященная на его святых мощах в г. Бари (Италия).
