Название селу, по преданию, дали многочисленные холодные родники-ключи, которые бьют из-под земли и сейчас. Довольно долго здесь не было своей церкви: до 1814 года Холодный входил в приход Дмитриевской церкви села Толстое, а затем ещё двадцать лет был приписан к Георгиевской церкви в слободе Коломыцево. Но за три года, с 1837 по 1840 год жители Холодного возвели свою церковь – во имя апостола и евангелиста Иоанна Богослова. С тех пор, с освящением церкви на свет появилась слобода Холодная.
В 1898 году в селе Холодное построили новую церковь в честь Иоанна Богослова. Богословский храм пережил все революции и страшные войны, но не смог вынести «хрущёвской оттепели» и в 1962 году был разрушен.
Новый храм построен Белгородским заводом ЖБК-1 по разработанной этим предприятием технологии сбора из крупногабаритных конструкций.
26 мая 2000 года состоялось освящение закладного камня для строительства новой церкви в Холодном, и уже 29 мая 2002 года архиепископ Белгородский и Старооскольский Иоанн совершил чин освящения нового храма.
