Первая деревянная церковь во имя Равноапостольных Жен Мироносиц была построена в 1566 году. Каменный пятиглавый храм был построен в период с 1714 года по 1722 год иждивением прихожанина купца Петра Родионова Худякова о чем свидетельствует церковная опись 1764 года. Освящён 12 июля 1724 года. Если обратиться к описанию Сретенского собора А. Поповым, напечатанным в «Вологодских епархиальных ведомостях» 1875 года, то годом начала строительства каменного храма можно считать 1710 год. Он пишет, что на западной стене церкви Жен Мироносиц, в простенке имеется надпись, «Начаток здания сея церкви 1710 году».
В трапезном иконостасе находились:
— образ Вседержителя с Иоанном Предтечей;
— образ святого Николая Чудотворца;
— образ Божией Матери, сидящей на престоле, со стоящим под ней ангелом хранителем, а по сторонам 46 печорских угодника;
— образ святого мученика Харлампия.
Из церковной утвари достоин внимания наперсный крест с 12-ю частицами мощей святых, «апостола Андрея Первозваннаго, архидиакона Стефана, Василия Великаго, Иоанна Милостиваго, велико-мученика Феодора Стратилата, мученика Пантелеймона, мученика Евстафия Плакиды, мученика Прокопия, мученика Анастасия Перскаго, мученика Mepкуpия, мученика Лукиана, и муч. Феодосии». 75 Внутри креста на кипарисе, в коем вложены мощи, подписаны наименования мощей и сохранилась надпись, «лета 7193 в сей святый крест положены сии святыя мощи в царствующем граде Москве, Благовещенскаго собора, что у ветхих врат на сенях, Иереем Иоанном, во славу святыя Троицы и Пречистыя Богородицы». На задней стороне креста написано, «лета 7193 сей святай крест Господень состроен тщанием гостя Семена Хрисанфова сына Шиловцова, жены ого Марфы Терентьевы дщери, в град Великий Устюг, на посад в церковь Владимирския Богородицы и святых жен Мироносиц».
Храм во имя Жен Мироносиц закрыт в феврале 1930 года. В настоящее время в нем находится «Музей новогодней игрушки», филиал Великоустюжского музея-заповедника.
