Приход в п. Верховье основан в 1995 году. Под храм, названный в честь Святой Троицы, было выделено здание бывшего радиолампового завода. Первоначально службы проводились в этом приспособленном здании, общая площадь которого составляла 150 кв.м.
В 1996 году по благословению архиепископа Паисия и согласовании местной власти было выделено место под строительство нового храма, расположенного в черте п. Верховье и утвержден проект строительства.
В этом же году возведен фундамент церкви Святой Троицы. 10 июля 1997 года совершено освящение фундамента, которое совершил архиепископ Паисий.
Строительство храма велось в течении 7 лет на средства прихожан, добровольных пожертвований организаций района и частных предпринимателей.
2004 году начались богослужения в новом храме.
17 июля 2010 года храм был освящен Высокопреосвященнейшим архиепископом Пантелеймоном.