Каменный одноэтажный теплый храм, находившийся на северной стороне монастыря, был заложен с 1817 года по 1823 год. Имел в длину 14 сажений, в ширину 7 сажений и в вышину 15 саженей, свод поддерживался четырьмя колоннами, наверху устроено пять глав. Был разобран в середине XX века.
В 2006 году на месте разобранного каменного одноэтажного теплого храма была сооружена новая небольшая одноглавая деревянная церковь с колокольней. Храм возведен благодаря чаяниям митрополита Симона Новикова, который избрал Николо-Бабаевский монастырь местом своего пребывания на покое. 11 августа 2006 года состоялось освящение престола храма, использовавшегося после закрытия монастыря для установки памятника Ленину.