В 1780 году, вместо деревянного приходского храма с. Духово, на территории монастыря для прихожан был построен кирпичный Крестовоздвиженский храм с приделом во имя Святителя Николая.
К 1821 году Крестовоздвиженский храм, находившийся на содержании крестьян села Духово, заметно обветшал. Его решено было разобрать, крестьяне же были присоеденены к приходу храма Дмитрия Солунского села Ямская Слобода. В том же году на освободившемся месте стараниями игумена Августина был построен каменный храм во имя Святителя Николая, а в 1829 году в нем устроен придел во имя Воздвижения Креста Господня…
К тому времени на территории монастыря всего было возведено три церкви, богато оснащенные и украшенные: Троицкий собор, церковь во имя святителя Николая-чудотворца, церковь во имя Нерукотворного образа Христа Спасителя. Безусловно, разнообразие и богатство церковной утвари, само строительство церквей не могли быть обеспечены только за счет весьма небольших ежегодных доходов монастыря, которые он имел в течение XVIII и XIX века. Роскошь убранства обители, о которой пишут и Русаков, и Геронтий, были бы невозможны без большой и постоянной помощи жертвователей из числа представителей самых знатных, состоятельных и влиятельных родов России, в их числе: князья Голицыны, Долгорукие, Хилковы, Шуйские, Васильчиковы, Воротынские; бояре Бордуковы, Саймоновы, Орлинские, Тимирязевы, Казаковы и др.
Особым почитанием пользовался чудотворный образ Святителя Николая Мирликийского Чудотворца («Николы Доброго») в Никольском храме. Эта икона, начиная с 70-х годов XVIII века, принимала участие в больших и малых крестных ходах. Самым продолжительным был ход от Троицына дня до сентябрьских праздников, завершающих церковный год, когда «жители села всех возрастов приходят в монастырь в полном праздничном наряде и, взявши св. икону, несут ее пешком иногда верст 40-50».
На сегодняшний день от Никольского храма частично сохранились лишь стены.
