Предположительно в 1390-е годы инок Печерского Нижегородского монастыря преподобный Макарий Унженский и Желтоводский чудотворец основал мужскую обитель. Обитель была названа во имя Богоявления Господня и стала известна как Макарьевская пустынь. По преданию, святой Макарий и его ученики выкопали под горой колодец, вода из которого считается целебной. В начале XVII века в период Русско-польской войны монастырь был разорён. Восстановлен при царе Михаиле Фёдоровиче. Имелся деревянный храм во имя Святой Живоначальной Троицы. В середине XVIII века в селе Нагорном построены однопрестольные приходские храмы в 1754 году на средства прихожан, летний пятиглавый храм Воскресения Христова, в середине XVIII века, зимний храм Николая Чудотворца. В комплекс входила также восьмигранная столпообразная колокольня, завершённая высоким шатром, костромского типа. Основание колокольни служило притвором храма Воскресения. При церквях находилось кладбище. Храмовый комплекс представляет собой пример позднего использования форм и приёмов допетровского зодчества в строительстве XVIII века. В 1764 году монастырь стал заштатным, оказался в бедственном положении. В 1767 году взамен обветшавшего деревянного храма Святой Троицы построен зимний каменный храм с шатровой каменной колокольней, живописью, резными Царскими вратами. Престола три: в честь Животворящей Троицы, в правом приделе, в честь преподобного Макария Желтоводского, в левом, великомученницы Екатерины. В храме находились древние иконы. В 1833 году монастырь обнесён каменной оградой с пятью башенками. Пережил бурю 1844 года и пожары 1854—1855 годов. Вновь оказался в бедственном положении. В 1900 году в монастырь поступила Мария Смертина, будущая преподобная Анимаиса Острецовская и Родниковская. Здесь она приняла монашеский постриг с именем Анимаиса и пребывала вплоть до закрытия монастыря. В 1901 году монастырь преобразован в женский, началось воссоздание обители. Наиболее чтимыми в монастыре были образ преподобного Макария и Казанская икона Божией Матери. 25 июля 1911 года в монастыре был заложен храм во имя Казанской иконы Божией Матери. Окончанию строительства помешали события, связанные с революцией. После 1917 года монастырь существовал в качестве женской сельскохозяйственной артели. Закрыт в конце 1920-х годов. 13 марта 1929 года оставшееся имущество монастыря было передано в действующий приходской храм Рождества Христова села Решмы. В 1940 году закрыт последний действовавший храм. Храм Святой Троицы и новый Казанский, а также ряд монастырских строений разобрали в 1940-е годы. Колокольня и ограда были разобраны во время войны. Позднее на месте Троицкого храма была построена школа. В бывших двухэтажных кельях разместился учебный корпус школы-интерната. Приходской храм Воскресения за годы советской власти превращён в руины. В 1991 году в Решме был открыт уцелевший приходской храм Николая Чудотворца и образован Свято-Никольский приход. В 1992 году в храм приехало несколько насельников Киево-Печерской лавры, и начала возрождаться монашеская жизнь. В 1994 году Свято-Никольский приход преобразован в Макариев-Решемскую монашескую общину. В 1998 году преобразован в мужской монастырь. Позднее монастырь вновь был преобразован в женский.
При монастыре ведётся просветительская работа, действует Православная школа имени преподобного Иоанна Кронштадтского, издаётся альманах «Свет православия», читаются лекции, насельники изучают литургику и православную педагогику. В монастыре хранятся частицы мощей преподобного Макария Желтоводского и многих других святых.
