Каменная церковь в селе Елизарьеве возведена в 1820 году попечением графини С. А. Толстой и ее дочери, в замужестве Закревской. В «Летописи Серафимо-Дивеевского монастыря» упоминается, как графиня посетила общину при Казанской церкви в Дивееве и, «соболезнуя убогому их положению, подарила им небольшую полосу своей земли, принадлежащую к земле общинки». Однопрестольная церковь была расписана учениками художественной школы Ступина. Росписи эти уникальны не только по технике исполнения, но и по библейским сюжетам.
К храму, как и в старину, ведут две дороги, из Арзамаса на Дивеево и Саров и со стороны Арзамаса, минуя села Ореховец, Онучино, Березино, Ивановское и Круглые Паны. С высоты холма у села Круглые Паны Никольская церковь в Елизарьеве особенно приметна, вызывая радость встречи с паломниками.
В 1930-х годах церковь в Елизарьеве была закрыта. В эти годы неоднократно арестовывали ее настоятеля отца Иакова. А 20 ноября 1937 года его арестовали прямо в храме и, не позволив зайти домой, увезли в арзамасскую тюрьму. В этот же день в Горьком расстреляли его младшего брата протоиерея Михаила, в 2001 году он включен в Собор новомучеников и исповедников Российских. Уже через четыре дня, 24 ноября, было подписано обвинительное заключение, а дело передано на рассмотрение тройки при УНКВД по Горьковской области. 2 декабря последовал приговор, расстрелять, имущество конфисковать. В протоколе стоит запись, «Расстрелян в Горьком 26 декабря 1937 года».
30 июля 2003 г. состоялось заседание Священного синода Русской Православной Церкви, на нем в Собор новомучеников и исповедников Российских XX века от Нижегородской епархии включено имя священномученика Иакова Гусева.
С 1991 году Никольская церковь в Елизарьеве вновь стала действующей. Начался долгий период реставрации, которая продолжается и поныне. 10 февраля 2006 года архиепископ Нижегородский и Арзамасский Георгий совершил чин освящения храма.
