Петропавловская церковь была первой кладбищенской церковью в истории Нижнего Новгорода. Приступая к коренному переустройству городов России на регулярной основе, Комиссия о каменном строении Санкт-Петербурга и Москвы в 1763 году встретилась с почти неодолимыми трудностями, погостами возле приходских церквей. Прокладка по ним улиц, естественно, вызывала негодование жителей.
В 1775 году в Нижнем Новгороде в полуверсте за Варварской решёткой отвели для общегородского кладбища свободное место, поставили часовню и обнесли оградой.
В 1781 году вчерне было отстроено здание Петропавловской церкви по проекту первого губернского архитектора Якова Ананьина, но в честь Петра и Павла главный престол был освящён лишь в 1785 году.
В советское время, 60-е годы ХХ века, в здании церкви находился кинотеатр «Пионер».
Храм Святых Апостолов Петра и Павла в Нижнем Новгороде возвращен верующим в 1990-е годы.
Здание бесстолпное, со световым барочных форм восьмериком на четверике, трапезной и трёхъярусной шатровой колокольней над западным входом, типа корабль. Колокольня уничтожена в советское время, на её месте в 2014 году была построена новая, двухъярусная и с куполообразной крышей. Барочные оконные наличники вытесаны из кирпича. Церковь является единственным сохранившимся в Нижнем Новгороде памятником русского барокко второй половины XVIII века.
