Памятник расположен к юго-востоку от Софийского собора и с запада от Софийской звонницы. Предполагается, что автором проекта был зодчий Б. Расстрелли. Построенная в 1759 году, при митрополите Димитрии Сеченове на средства императрицы Елизаветы, церковь воздвигнута на месте древнего новгородского храма 1336 года, выстроенного архиепископом Василием. В 1338 году храм был расписан фресками. В 1882 году теплый собор был обновлен, стены оштукатурены и покрашены.
В 1944 году, при раскопках под руководством М.К. Каргера, к востоку от алтаря современной церкви удалось обнаружить фрагменты фресковой штукатурки XIV века с яркой красочной росписью.
Закрыт в 1929 году. В 1932 году в храме открылся Художественный музей. Во время войны разрушены купол и перекрытия. В 1953 году в церкви был проведён ремонт, разобраны купол и барабан. Восстановлена без купола, только одна апсида напоминает о том, что когда-то это было культовое строение. В настоящее время не является действующим храмом, используется с 1960-х годов как Лекторий Новгородского музея.
В 2009 году в ходе прокладки кабеля у южных стен храма был обнаружен фундамент древней церкви Входа в Иерусалим постройки 1336 года. В 2010 году на месте были начаты археологические изыскания.
Здание вытянутое, одноэтажное, прямоугольное в плане, без внутренних столбов, с вальмовым покрытием. С севера примыкает квадратная пристройка. Фасады здания решены в ордерной системе, расчленены дорическими пилястрами. Завершение небольшой деревянный восьмерик. Образец стиля «барокко». Доминирующее здание Софийского собора.
