В восьми километрах к северу от Сергиева Посада, на шоссе Углического тракта, расположилось село Мишутино, а в нем Богородицерождественская церковь. Впервые Мишутино упоминается в Духовной грамоте великого князя Ивана III как центр Мишутинского стана. Документы 1621-1622 годов называют его «старинной вотчиной» Якова Гавриловича Писемского и отмечают в нем деревянную клетскую церковь Рождества Пресвятой Богородицы, построенную на средства землевладельца при участии крестьян.
В 1699 году часть села оказалась в собственности сержанта Преображенского полка Александра Данилова, сына Меньшикова. С начале XVIII века селом владел Троице-Сергиев монастырь, а с 1764 года Мишутино стало числиться в составе частных земель. Храм Рождества Пресвятой Богородицы просуществовал здесь не более 1781 года.
В конце XVIII века в Мишутино числились деревянный господский дом и деревянная Спасская церковь с приделом в честь Рождества Пресвятой Богородицы. С 1799 года в церкви из-за ветхости постройки службы уже не совершались. В 1805 году в Мишутино на пожертвование прихожан возвели каменный храм с тремя престолами, во имя Всемилостивого Спаса, верхний, в честь Рождества Пресвятой Богородицы и иконы Божией Матери «Всех Скорбящих Радость», нижние. В церкви находилась местночтимая икона Божией Матери «Страстная». В 1842 году «усердием дворянина и кавалера» Алексея Гавриловича Попова была построена отдельно стоящая колокольня. В селе действовала церковноприходская школа, имелась часовня. В XIX веке Мишутино делилось на две части, в народе их называли барщинами, они принадлежали двум разным помещикам, жившим в соседних поселениях. В 1880-х годах приход Мишутинской церкви состоял из самого села и 6 деревень, в которых по клировым ведомостям 1885 года насчитывалось 855 прихожан. В 1923 году в Мишутино числилось 63 двора.
С 1917 года по 1928 год ,в Богородицерождественской церкви служил иерей Павел Преображенский, будущий священномученик. В 1928 году он был назначен настоятелем храма села Синьково Дмитровского района. 30 сентября 1937 года по ложному обвинению в контрреволюционной агитации он был арестован и 21 октября расстрелян. В 1930 году Мишутино было преобразовано в колхоз имени 2-й пятилетки. В 1937 году храм закрыли, последнего настоятеля, иеромонаха Лаврентия Насонова, монаха Гефсиманского скита арестовали. 10 декабря 1937 году его расстреляли на полигоне в Бутово под Москвой. В церкви устроили зерносушилку, позднее там случился пожар. Во время Великой Отечественной войны, в 1943 году в здании храма организовали столовую. Очередной пожар уничтожил внутреннюю часть храма, рамы и двери. В 1970-х годов провалился купол церкви.
До 1991 года храм в Мишутино стоял заброшенным, а затем был передан православной общине. Началось возрождение и восстановление святыни. Первым настоятелем храма был назначен священник Алексей Савицкий. В 1993 году настоятелем храма стал священник Александр Захаров. Потихоньку храм стал преображаться. В настоящее время трудами настоятеля восстановлены колокольня, крыша, пол, купол, кресты. Подведено отопление, благоустраивается церковный двор. В дни пасхальной радости 2003 года благочинный священник Александр Самойлов, посетив Мишутинскую церковь, передал в дар храму писаную маслом аналойную икону Воскресения Христова. В 2005 году. Богородицерождественская церковь отметила свое двухсотлетие.
В 2009 году настоятелем храма назначен священник Сергий Мошков.
