Церковь Григория Богослова была возведена в 1670-х годах, вместе с остальными постройками на территории Митрополичьего сада. В 16 веке на месте церкви располагались палаты Григорьевского монастыря, который был упразднен в 17 веке во время строительства нового Архиерейского двора. Новую церковь построили на месте старого фундамента. При этом она прекрасно вписалась в общую панораму Ростовского кремля.
Первоначальное убранство интерьера храма погибло во время пожара 1730 года. Остается неизвестным была ли церковь Григория Богослова в 17 веке. Как и все прочие церкви Ростовского архиерейского дома, расписана фресковой живописью.
В 1740-х годах при архиепископе Арсении интерьер храма Григория Богослова оформили лепниной и плафонной клеевой живописью. Зеленоватые стены церкви внутри делятся каннелированными пилястрами, между ними пространство заполнено лепниной с мотивами цветов, картушей и раковин. Их сочные и грубоватые формы выполнены с причудливым декоративным вкусом и большим темпераментом, чем выдают руку мастера из простонародья.
В картушах, евангельские сцены. На западной стене, Преполовение, Благовещение, Беседа с Никодимом. На южной стене храма, Вход в Иерусалим. На северной, Рождество Богоматери. В барабане, Отечество. В алтаре, Тайная вечеря, Саваоф, Моление о чаше.
В 1884 году интерьер церкви обновила в русском стиле артель Н.М. Сафонова. Реставрационные работы проводились на средства крестьянина И.А. Рублева, под контролем Московского Археологического Общества. Во время проведения этой реставрации была переделана живопись в картушах. В нижней части западной стены в центральном кубе, были написаны клейма, Нагорная проповедь, Изгнание торгующих из храма, Насыщение десяти тысяч десятью хлебами. На восточной стене выписана фигура Антония Римлянина, который плывет на камне в Новгород из Рима. Оконные откосы заполнены травным орнаментом в русском стиле, который состоит из зеленых и красных побегов на желтом фоне. Травной узор снизу доверху покрывает стены и своды храма, паперти и притворы. В то же время в окна вставили узорчатые рамы с разноцветными стеклами.
В 1880-х годах в церкви Григория Богослова был сооружен новый иконостас, который украшен позолоченной плоской резьбой, выполненной на красном фоне. Царские врата для иконостаса изготовил ростовский резчик Никольский по образу царских врат Богословского храма на Ишне. Сегодня эти врата перенесли в Ишненскую церковь, а настоящие уникальные врата из храма Иоанна Богослова, вырезанные в 1562 году иноком Исайей, сейчас представлены в экспозиции Ростовского музея.
Все иконы пятиярусного иконостаса изготовлены в 1880-х годах мастерами сафоновской артели, в том числе и местными, Богоматерь с предстоящими Антонием и Феодосием, Вседержитель с евангелием, Стефан Пермский в житии, Григорий Богослов, Преподобная Елизавета, Зачатие Иоанна Предтечи.
