Часовня на углу Иоанновского переулка и ул. Профессора Попова была выстроена на территории Свято-Иоанновского монастыря в 1999-2000 годах с благословения патриарха Московского и всея Руси Алексия II. Её строительство приурочено к 100-летнему юбилею монастыря. Внешний облик часовни воссоздан архитектором А.П. Викторовым (бывшим главным архитектором Санкт-Петербурга) по архивным чертежам утраченной в 1930-х годах Серафимовской часовни. Освящена во имя Покрова Пресвятой Богородицы.