Единственный в Эстонии памятник Пирогову находится в Тарту на холме Тоомемяги. Он был торжественно открыт в декабре 1952 года. Парк, в котором он установлен, пользуется большой популярностью среди сегодняшних студентов, которые начиная с весны собираются у подножия монумента. Недалеко отсюда и до университета, в котором в XIX столетии светило русской медицины делился знаниями с будущими врачами. После открытия этого памятника в Тарту появилась пословица. Птицы прилетают, значит, весна пришла. А в Тарту она стала «студенты собираются, значит, весна пришла», т.к. студенты местного медицинского университета всегда собираются у этого памятника Пирогову.
Над его созданием трудилась группа скульпторов, в состав которой входили Й.Раудсепп, П.Тарвас, А.Вольберг, М.Мельдер, однако чаще всего в путеводителях и справочниках упоминается только Раудсепп.
Памятник представляет собой установленный на высоком гранитном постаменте бюст хирурга. На основании постаменте указаны годы жизни Николая Ивановича и написано его имя на русском языке. В нижней части второго сектора постамента размещён герб с узнаваемой медицинской символикой.