Новохоперский краеведческий музей располагается в двухэтажном старинном особняке в центре города, построенном в 1870 году. Изначально – это был жилой дом, который, кстати говоря, отапливался единственным подвальным камином (теплый воздух сначала проходил под полами первого этажа, а затем уже поступал в дымоходы, внутри массивных стен).
После бурных событий начала двадцатого века в этом особняке с тридцатых годов прочно квартировали только воинские штабы. С мая по сентябрь 1943 года в Новохоперске формировалась Первая чехословацкая бригада под командованием Людвига Свободы. И ее штаб тоже находился здесь.
…В 1961 году случился официальный визит Людвига Свободы в Новохоперск, уже в качестве президента Чехословакии,. И теплая дружба новохоперцев и чехословацких воинов, сложившаяся в трудные годы, ожила с новой силой. Сюда стали постоянно приезжать делегации из ЧССР, а новохоперцы по приглашениям гостей зачастую наносили ответные визиты.
К 1973 году особняк занимал городской Совет, а в одном из помещений первого этажа был создан небольшой музей советско-чехословацкой дружбы, открытие которого приурочили как раз к 30-летию формирования в Новохоперске первой чехословацкой бригады. Организатором этого музея стал местный краевед Александр Алексеевич Соломенцев.
Фонды Новохоперского краеведческого музея формировались в 1980-е , в 1985-м он получил официальный статус, в 1986-м — начал работать с посетителями (к этой поре городской Совет переехал в новое здание и весь особняк, по сути, стал музеем). Одной из изюминок его экспозиции стал музей в музее. К этой поре он также заметно расширился. В двух залах первого этажа бок о бок поместились две значимые страницы истории Чехословакии и старинного города Новохоперска (первая страница, естественно, посвящалась лихолетью, вторая – дружбе в мирные годы).
До 1990-года музей советско-чехословацкой дружбы в Новохоперском краеведческом музее стоял на особом счету в Министерстве культуры СССР вместе с музеем в с. Соколово Харьковской области. На сегодняшний день он является единственным в своем роде на постсоветском пространстве.
Около двадцати пяти лет своего существования Новохоперский краеведческий музей пребывал под юрисдикцией Новохоперского городского Совета и являлся просто структурным подразделением Дома культуры.
В 2010 году на былой базе было организовано Муниципальное учреждение «Новохоперский краеведческий музей» с правом юридического лица, учредителем которого стала администрация Новохоперского муниципального района.
На сегодняшний день Новохоперский краеведческий музей пребывает под юрисдикцией Новохоперского муниципального района в качестве муниципального казенного учреждения.
Ремонты здания изнутри и снаружи, случившиеся в последние годы, значительно изменили его облик, сохранив при этом все черты исторической сути.
