По преданию, на старых пнях, оставшихся после рубки леса, в 1688 году был поставлен деревянный храм. Новый храм построен в 1863 году на средства крестьянина Алексея Адрианова Писцова по типовому проекту архитектора К. Тона. Каменный, одноглавый, с ярусной колокольней. В 1892 году расписан на средства купца Дмитрия Кононовича Кекина. Престол во имя святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских, чудотворца. Особенно почитались храмовая икона святителя Николая, чудотворца, написанная в пошехонском Адриановом монастыре, и икона Божией Матери, именуемая «Всех скорбящих радость».
Закрыт в 1933 (1934?) году. В советский период в храме был склад зерна. Источник информации: «Монастыри и храмы земли Ярославской», краткая иллюстрированная энциклопедия в 3-х томах, том первый, 2000 год
Никола-Пенье, владельческое село, при прудах и колодцах, в 28 верстах от Ростова; в нем 25 дворов, 58 душ и 62 надела. Каменная пятиглавая, в связи с колокольнею церковь во имя св. Николая построена в 1863 г. усердием крестьянина Писцова, а прежде создания этого храма в селе находилась церковь деревянная, которая и была окончательно нарушена 28 июня 1878 г.
Из местно чтимых икон следует указать на храмовую икону св. Николая с надписью: «написался сей святой образ в Ростовском уезде в церковь св. Николая, зовомый что на Пенье. А строил сей образ Адриановой пустыни игумен Иаков по своим родителям своими келейными деньгами».
Крестных ходов в приходе бывает два: 9 мая – в честь храмового праздника и 28 июля, установленный с давних пор в память скотского падежа. При церкви числится 33 десятины земли и приход из одного селения.
Относительно возникновения села существует следующее предание: на том месте, где стоит теперь село, был лес, рубленный для постройки деревянной церкви при д. Клепках. Когда построили основание церкви, то бревна раскатились на ту сторону, где был рублен лес, вследствие чего постройка церкви была перенесена на пни рубки, а затем и вся деревня Клепки переселилась к новосозданной церкви. Местность, где стояла эта деревня, до сих пор носит название «Клепки».
А. А. Титов «Ростовский уезд Ярославской губернии». Москва. В Синодальной типографии, 1885 г.
