Храм начал строится с зимы 1992 года. 4 ноября 1993 года, в день Казанской иконы Божией Матери, Храм был освящен Преосвященным епископом Якутским и Вилюйским Германом.
Осенью 1999 года при Казанском храме г.Нерюнгри открылся филиал Богословского Свято-Тихоновского православного института.
