Каменый храм был построен в 1877 году святителем Игнатием (Брянчаниновым) вместо обветшавшей Иверской церкви. В конце 20-х — середине 30-х годов его начали разбирать на кирпич и увозить в поселок Красный Профинтерн для строительства бани. Однако качество и крепость стен храма были настолько высоки, что он не поддавался дальнейшей разборке, поэтому решено было его взорвать. Для этой цели летом 1940 года в монастырь приехала специальная бригада взрывников, которая заложила в просверленные в стенах храма Иверской Божьей Матери отверстия взрывчатку и произвела его уничтожение. Главный купол храма был «посажен» в нижнюю подвальную часть.
На месте разрушенного храма был вновь построен Иверский храм. В марте 2014 года впервые в храме Божественную литургию отслужил митрополит Ярославский и Ростовский Пантелеимон. 17 мая владыка совершил чин великого освящения храма и отслужил во вновь освященном Иверском храме Божественную литургию.
В 2009-2014 выстроена новая четырёхстолпная одноглавая одноапсидная церковь, близко воспроизводящая формы новгородского храма Феодора Стратилата на Ручью. Великое освящение совершено 17 мая 2014.
https://monasterium.ru/monastyri/monastery/nikolo-babaevskiy-muzhskoy-monastyr/