Заложен в 1994 году. Нижний придел Успенского собора в виде пещерного храма освящён во имя Живоносного Креста и Страстей Господних.
Успенский собор — главный и самый большой храм Ачаирского женского монастыря, средоточие его литургической и духовной жизни, архитектурная доминанта всего монастырского комплекса. Закладка собора была совершена весной 1998 года, а уже в начале 2000-го последний, девятый купол занял свое место, и храм обрел в целом завершенный внешний облик. 28 августа 2000 года в уже окончательно выстроенном Успенском соборе была совершена первая Божественная литургия. Авторы проекта этого уникального образца храмового зодчества — Геннадий Адаев и Татьяна Столбова.
Богослужения в соборе начались, едва появилось место, где служащим можно встать: молебны и акафисты, позднее — литургии служились прямо на стройплощадке. Уникальность Успенского собора ощущается сразу, едва переступаешь его порог, и взору предстает напоенное светом, уходящее куда-то ввысь пространство, в котором, как драгоценный камень в блистательной оправе, заключен изумляющий дух белый с голубизной и золотом иконостас — работа епархиального иконописца и архитектора Геннадия Адаева и резчика Владимира Малых. Даже человек, неискушенный в знании канонов устроения храмового пространства, сразу обращает внимание на необычный золотой резной купол, осеняющий часть алтаря с престолом и композиционно объединенный с иконостасом. Поистине ювелирная филигранность исполнения Царских врат в очередной раз напоминает о высшем Небесном достоинстве Ходящего ими. У граней массивных колон в напольных кивотах помещены Богородичные иконы: «Ачаирская», «Успение», «Всецарица», «Взыскание погибших».
Акустика собора превосходна: в нем не только удивительно звучат хоры церковные, но и на редкость отчетливо каждое слово службы в алтаре достигает самого дальнего уголка притвора. Две лестницы у северной и южной стен спускаются из верхнего, заполненного светом храма в крипту собора, где у самого земного лона находится скорбное сердце монастыря — Сибирская Голгофа. Пещерный храм, где находится Сибирская Голгофа, является напоминанием о страшном времени сталинских репрессий, о тяжелых временах, которые переживала Русская Православная Церковь с приходом власти большевиков.
Сибирская Голгофа — уникальный храм, расположенный в крипте Успенского собора, посвященный священной памяти Крестных Страстей Господних и сонма новомучеников и исповедников Российских, в числе коих достойное место занимают и новомученики Омские. Этот трехпрестольный храм являет собой материализованное воплощение молитвенной памяти всех наших соотечественников, ушедших в вечность во времена воинствующего богоборчества. В центре крипты, в полу под символическим изображением Вифлеемской звезды, находятся под спудом уложенные в ковчежец останки людей — найденные на месте безымянных захоронений жертвы 8-й колонии ГУЛАГа, вынесенные водой на берег Иртыша, а также найденные при строительстве монастыря.
Сегодня в Пещерном храме находится святыня, которая привлекает сюда многочисленных паломников – это гроб священномученика Сильвестра, который был обретен вместе с мощами Святителя 21-22 июля 2005 года.
