Мимо этого величественного здания не может пройти ни один гость нашего города. Построенный на средства тотемских купцов-компанейщиков, мореходов Григория и Петра Пановых, Входоиерусалимский храм-корабль с колокольней-мачтой считается одной из вершин северного барокко. К 300-летию русского флота на первом этаже церкви был открыт музей мореходов, полностью посвящённый тем удивительным страницам истории города, благодаря которым мы можем говорить о славе Тотьмы как «города русских Колумбов».
Тотемскими купцами во второй половине восемнадцатого века было снаряжено порядка двадцати экспедиций к восточным рубежам России, побережью Тихого океана, Аляске, Алеутским островам. Основной целью таких путешествий была добыча пушнины, ценившейся в то время исключительно высоко, и в этом деле тотьмичи достигли значительных успехов. О промысловых походах знала императрица Екатерина Великая, в 1780 году утвердившая герб Тотьмы с чёрной лисой на золотом поле «в знак того, что жители сего города в ловле сих зверей упражняются».
Музей мореходов содержит три тематических комплекса. Первый из них посвящён истории российского флота с момента его зарождения. Во втором зале подробно рассказывается об истории тотемского мореходства, его влиянии на жизнь города, о храмах, возведенных на средства тотемских купцов-компанейщиков. Третий зал посвящён ХХ веку и судьбам тотьмичей, которые служили на флоте, а также новому проекту, продолжающему традиции тотемского мореходства «Школе путешественников Фёдора Конюхова».
На колокольню, где воссоздана действующая звонница, в часы работы музея можно подняться, считается, что это лучшая высотная точка для обзора города. Профессиональные звоны ежедневно исполняет сотрудник музея Андрей Алексеевич Новиков.
На втором этаже находится храм Николая Чудотворца, освящённый в 2017 году. В его помещении фрагментарно сохранились росписи, осмотреть их возможно в часы работы церкви, не зависящие от руководства и сотрудников музейного объединения.
В 2020 году музей мореходов готовится переехать в комплекс усадьбы купца Фёдора Холодилова на Набережной Кускова.
Администрация музейного объединения приносит извинения перед посетителями за следы незавершённого ремонта в музее и просит отнестись с пониманием.
