Музей основан в 1983 году к 240-летию города Оренбурга. Состоит музей из 9 стационарных экспозиций, рассказывающих об истории города с древнейших времен: основание города на восточной границе России; крестьянская война под предводительством Е. Пугачева; Оренбург в 1 половине XIX века; пребывание А.С. Пушкина в Оренбурге; архитектура города, этнография; управление краем; известные люди России – наши земляки: М. Карамзин, Г. Державин, И. Крылов. Исследователи края: И. Лепехин, П. Паллас, П. Рычков, Э. Эверсман, А. Гумбольдт.