После возрождения монастыря в 1996 г. его территорию пришлось перепланировать: в северо-восточную часть перенесено кладбище. Определить места прежних захоронений было невозможно, т.к. в 1918 г. при строительстве на территории монастыря воинской части, из оскверненных могил кости сваливались к собору и остались под асфальтом плаца, устроенного на месте кладбища. Чтобы почтить память всех некогда похороненных здесь монахов, благодетелей обители и знатных горожан дворянского и купеческого сословия, была устроена в 1999-2000 гг. поминальная часовня–костница, куда перенесли все найденные на старом кладбище останки. И ныне монахи собирают эти останки со всей территории монастыря и хоронят их в этой часовне. Первоначальный вид часовни-костницы впоследствие был изменен и ныне перестроен по афонскому образцу. В часовне служат панихиды об усопших, в ней можно поставить свечку и оставить записку о упокоении.
По материалам: А.А. Горская «Муром. Путеводитель», изд. ИП Верхов С.И. 2017 г. и информационного плаката у часовни