До 1937 г. в Малой Вишере действовал каменный Никольский собор. Его, как водится, закрыли, духовенство репрессировали. После Великой Отечественной войны, как местные верующие ни хлопотали о регистрации религиозной общины, им было отказано. Лишь дети и внуки тех, кто помнил каменный собор, добились воссоздания маловишерского прихода. Райисполком проявил щедрость и по просьбе общины передал ей для перестройки под храм заброшенный деревянный дом у старого кладбища. Работы велись в 1989-1990 гг. К «дареному» дому пристроили алтарь и трапезную часть с колокольней; один из еще работавших тогда заводов Малой Вишеры бесплатно изготовил луковичную главку.
Богослужения в храме, созданном по принципу «с миру по нитке», совершаются с января 1991 г. — освящение совершил архимандрит Ефрем (Барбинягра), нынешний епископ Боровичский.
