Церковь построена в 1860 — 1862 гг. стараниями помещиков Каргопольцевых – Глафиры Васильевны и ее сына Николая Николаевича.
Сначала церковь была приписана к церкви в селе Досифеева пустынь, расположенном в 12 верстах от Леушина, и притом по плохой дороге. Это создавало неудобства для богослужений. В 1864 г. к церкви был определен самостоятельный причт — священник и псаломщик. С 1876 года церковь вновь стала приписной — она была передана в ведение Леушинской общины, а затем Леушинского монастыря. Церковь, приписанная к монастырю и давшая ему название, осталась за монастырской оградой и была приходской церковью деревни Леушино.
Историческое описание Иоанно-Предтеченского женского монастыря Череповецкого уезда, Новгородской губернии. СПб, 1890. http://www.knigafund.ru/books/124006
